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1、 目的:應用新型的自身淬滅熒光引物(LUXPrimer)原理及技術(shù),建立一種快速、特異、敏感和準確的定量檢測SARS冠狀病毒RNA的實時熒光定量RT-PCR方法?! 》椒ǎ焊鶕?jù)已公布的SARS冠狀病毒全基因序列,利用BLAST,Clustalx,RNAstructure等軟件分析得到PCR擴增的靶序列。應用LUXTMDesigner軟件設(shè)計引物,借助計算機輔助,分析其保守性和特異性并進行優(yōu)化。通過TA克隆,將靶序列的cDNA克隆到到
2、pGEM-T載體上,應用SP6RNA聚合酶經(jīng)體外轉(zhuǎn)錄得到靶序列,作為RT-PCR反應體系優(yōu)化和評價實驗的模板。對RT-PCR反應體系中的Mg2+,dNTP和引物濃度進行優(yōu)化。將體外轉(zhuǎn)錄得到的RNA作為模板,對方法的靈敏度,定量線性范圍,精密度等進行評價。 結(jié)論:本實驗建立的自身淬滅實時熒光定量RT-PCR能夠快速,準確,敏感地對SARS冠狀病毒核酸進行定量分析,具有較大的定量范圍。有望為臨床SARS冠狀病毒基因的早期定量檢測提供一種
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