布魯氏菌熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及應(yīng)用.pdf_第1頁(yè)
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1、目的:布魯氏菌病作為一種人畜共患病,嚴(yán)重威脅著環(huán)境及人類身體健康,建立一種快速、可靠的布魯氏菌檢測(cè)方法,對(duì)其預(yù)防及診斷都具有重要意義。而熒光定量PCR檢測(cè)技術(shù)是一種公認(rèn)的簡(jiǎn)單、靈敏、快速的檢測(cè)方法。但是,在諸多布魯氏菌熒光定量PCR檢測(cè)方法的報(bào)道中,人們沒有意識(shí)到抑制物的存在將影響本方法用于樣品檢測(cè)的準(zhǔn)確性及可靠性。因此本文建立了一種含兩種內(nèi)參基因的布魯氏菌熒光定量PCR方法,在快速、靈敏的檢測(cè)布魯氏菌的同時(shí),質(zhì)控樣品DNA及PCR檢測(cè)

2、過程,提高檢測(cè)結(jié)果的可靠性及準(zhǔn)確度。
  方法:以哺乳動(dòng)物beta-actin基因?yàn)閮?nèi)源性內(nèi)參基因,質(zhì)控樣本DNA;以重組質(zhì)粒為外源性內(nèi)參基因,質(zhì)控PCR擴(kuò)增過程。針對(duì)布魯氏菌屬特異性基因IS711,建立用于樣品檢測(cè)的布魯氏菌熒光定量PCR方法,優(yōu)化布魯氏菌引物濃度、探針及反應(yīng)溫度,并驗(yàn)證其敏感性、特異性及穩(wěn)定性,做標(biāo)準(zhǔn)曲線。將該方法用于樣品檢測(cè),并與細(xì)菌分離培養(yǎng)檢測(cè)結(jié)果比較。之后,將陽(yáng)性樣品進(jìn)行布魯氏菌的SNP基因分型。

3、  結(jié)果:⑴確立了將哺乳動(dòng)物的beta-actin基因作為內(nèi)源內(nèi)參基因,并設(shè)計(jì)出特異性引物及探針。用于質(zhì)控樣品DNA提取物;選取大西洋鮭魚β-球蛋白基因片段,建立了外源重組質(zhì)粒作為外源性內(nèi)參,用于質(zhì)控PCR擴(kuò)增。⑵建立并優(yōu)化了布魯氏菌熒光定量PCR檢測(cè)方法。⑶建立布魯氏菌標(biāo)準(zhǔn)品,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線:只擴(kuò)增布魯氏菌DNA時(shí),相關(guān)系數(shù)R2為0.999(Y=-3.34X+42.85);擴(kuò)增布魯氏菌和外源重組質(zhì)粒時(shí),相關(guān)系數(shù) R2為0.997(Y=-

4、3.13X+40.50);同時(shí)擴(kuò)增布魯氏菌及內(nèi)外源性內(nèi)參基因時(shí),相關(guān)系數(shù) R2為0.997(Y=-3.12X+40.9)。說明加入的外源及內(nèi)源內(nèi)參基因?qū)Σ季鷻z測(cè)沒有太大影響。本檢測(cè)方法的檢測(cè)線達(dá)5.6拷貝·μL-1,在特異性檢測(cè)中,布魯氏菌引物及探針只擴(kuò)增了六種經(jīng)典布魯氏菌,對(duì)陰性參考菌均無非特異性擴(kuò)增。而且,本檢測(cè)方法穩(wěn)定性良好。⑷將本方法用于樣本檢測(cè),共檢測(cè)了30份動(dòng)物組織樣品,360份動(dòng)物全血,91份奶樣,其中檢測(cè)出7份布魯氏菌陽(yáng)

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