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1、作為生命的物質(zhì)基礎(chǔ)之一,蛋白質(zhì)在催化生命體內(nèi)各種反應(yīng)進(jìn)行、調(diào)節(jié)代謝、抵御病原微生物的入侵及控制遺傳信息等方面都起著至關(guān)重要的作用。隨著后基因組時(shí)代的來臨,蛋白質(zhì)組學(xué)已成為國(guó)際的主攻領(lǐng)域,是生命科學(xué)最重要的研究領(lǐng)域之一。對(duì)蛋白質(zhì)組成的分析鑒定是蛋白質(zhì)組學(xué)中的主要內(nèi)容,它要求對(duì)蛋白質(zhì)組進(jìn)行表征,即所有蛋白質(zhì)的分離與鑒定及其圖譜化。同時(shí),質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展使得MS/MS成為蛋白質(zhì)組學(xué)的核心技術(shù),特別是對(duì)于蛋白質(zhì)復(fù)合物的鑒定、蛋白質(zhì)互聯(lián)網(wǎng)的解析
2、等方面也有著重大的應(yīng)用。目前,已有多種對(duì)串聯(lián)質(zhì)譜與數(shù)據(jù)庫(kù)中多肽的理論質(zhì)譜的一致性進(jìn)行評(píng)估的高通量計(jì)量算法用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究中。然而,它們?nèi)源嬖谥@著的多肽鑒定誤差率,因此發(fā)展算法以提高多肽鑒定的準(zhǔn)確性仍是目前蛋白質(zhì)組信息學(xué)研究的熱點(diǎn)。 因此,首先本文針對(duì)蛋白質(zhì)的多組分體系,對(duì)投影圖旋轉(zhuǎn)分析法進(jìn)行了改進(jìn),擴(kuò)展其應(yīng)用范圍;其次,對(duì)于蛋白質(zhì)的LC-MS/MS串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù),本文結(jié)合色譜方向上的保留時(shí)間信息,提出了一種結(jié)合保留時(shí)間信息的串
3、聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)的預(yù)處理解析策略,并使用該數(shù)據(jù)預(yù)處理解析策略處理實(shí)驗(yàn)測(cè)得的數(shù)據(jù),從而獲得較高的氨基酸序列覆蓋率,提高了蛋白質(zhì)的檢索得分。 本文主要分為三個(gè)部分:第一部分為投影圖旋轉(zhuǎn)分析法在蛋白質(zhì)LC-MS體系中應(yīng)用。這一部分闡述了投影圖旋轉(zhuǎn)分析的基本原理及算法,同時(shí)針對(duì)蛋白質(zhì)多組分分析體系,我們利用超平面的概念對(duì)此算法進(jìn)行了進(jìn)一步的改進(jìn),并對(duì)三組分實(shí)驗(yàn)體系和五組分實(shí)驗(yàn)體系進(jìn)行了分析與討論。 第二部分為串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)的解析與研究。
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