7個編碼變異與中國漢族人尋常型銀屑病臨床表型的相關(guān)性研究.pdf

1、研究背景：銀屑病是一種由多因素引起的慢性炎性復(fù)雜性皮膚病,臨床以紅色斑塊及鱗屑為特征,尋常型銀屑病(Psoriasis vulgaris,PV)最常見,占90％左右。目前該病的病因及發(fā)病機(jī)制尚不完全清楚,大都學(xué)者認(rèn)為銀屑病的發(fā)生是由遺傳與環(huán)境相互作用共同導(dǎo)致的,并且遺傳在銀屑病的發(fā)病中占重要地位。近年來,本課題組通過靶向測序技術(shù)在全基因組外顯子區(qū)域發(fā)現(xiàn)了銀屑病的7個編碼單核苷酸變異位點(diǎn)(single-nucleotide variant

2、s,SNVs):IL23R chr.1:67421184(c.530 G>A),GJ B2 rs72474224(c.324C>T),LCE3D rs512208(c.185C>A),ERAP1 rs26653(c.727G>C),ERAP1 rs27044(c.2535C>G),ZNF816A rs12459008(c.590T>A),FUT2 rs1047781(c.418A>T).本研究在此基礎(chǔ)上進(jìn)一步探討7個SNVs與中國漢族人

3、PV臨床表型的相關(guān)性。
　　目的：探討7個SNVs與中國漢族人PV臨床表型(包括發(fā)病年齡、發(fā)病的嚴(yán)重程度、發(fā)病類型、有無家族史)的相關(guān)性,為銀屑病的發(fā)病機(jī)制提供重要的遺傳學(xué)依據(jù)。
　　方法：9946例患者和9906例正常對照的臨床資料是通過以調(diào)查問卷的形式并且填寫統(tǒng)一設(shè)計的銀屑病調(diào)查表和正常對照調(diào)查表獲得,9946例患者和9906例正常對照的7個SNVs的基因分型資料均來源于先前通過靶向測序技術(shù)在全基因組外顯子區(qū)域得到的基因

4、分型數(shù)據(jù),對臨床表型資料和基因型數(shù)據(jù)用Microsoft Excell2010軟件進(jìn)行分類整理后,在 SPSS19.0軟件中應(yīng)用Χ2檢驗(yàn)對數(shù)據(jù)資料進(jìn)行統(tǒng)計分析來比較各組間基因型和等位基因的頻率分布狀況。
　　結(jié)果：1.7個SNVs的基因型和等位基因頻率分布在病例組與對照組間均有統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型<0.05,P等位基因<0.05);2.GJB2 rs72474224(c.324C>T)基因型和等位基因頻率分布在急性點(diǎn)滴型患者組和慢

5、性斑塊型患者組間均有統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型=0.003,P等位基因=6.22×10-4),在表型病例組與對照組間僅僅在點(diǎn)滴患者組-對照組、重度患者組-對照組無統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型>0.05,P等位基因>0.05),在其他表型病例組-對照組間均有統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型<0.05,P等位基因<0.05);3.LCE3D rs512208(c.185C>A)等位基因頻率分布在早發(fā)型患者組和晚發(fā)型患者組間有統(tǒng)計學(xué)意義(p=0.03),而基因型頻率分

6、布無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.06),在表型病例組與對照組間其基因型和等位基因頻率分布均有統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型<0.05,P等位基因<0.05);4.ZNF816A rs12459008(c.590T>A)基因型和等位基因頻率分布在早發(fā)型患者組和晚發(fā)型患者組間均有統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型=0.008,P等位基因=0.02);在表型病例組與對照組間僅僅在晚發(fā)型患者組-對照組、重度患者組-對照組間無統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型>0.05,P等位基因>0.05

7、),在其他表型病例組-對照組間均有統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型<0.05,P等位基因<0.05);5.IL23R chr.1:67421184(c.530G>A),ERAP1 rs26653(c.727G>C),ERAP1 rs27044(c.2535C>G)和FUT2 rs1047781(c.418A>T)的基因型和等位基因頻率分布在中國漢族人PV的臨床表型病例組間均無統(tǒng)計學(xué)意義(P基因型>0.05,P等位基因>0.05)。
　　結(jié)論：

8、1.7個SNVs均與中國漢族人PV的易感性顯著相關(guān);2.GJB2 rs72474224(c.324C>T)與中國漢族人PV的發(fā)病皮損類型相關(guān)性可能更為顯著,尤其是慢性斑塊型銀屑病;3.LCE3D rs512208(c.185C>A)與中國漢族人PV的發(fā)病年齡相關(guān)性可能更為顯著,尤其是早發(fā)型銀屑病;4.ZNF816A rs12459008(c.590T>A)與中國漢族人 PV的發(fā)病年齡相關(guān)性可能更為顯著,尤其是早發(fā)型銀屑病。5.IL23R