UBLCP1等多個(gè)基因插入-缺失變異與漢族人群銀屑病易感性的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、研究背景：銀屑?。╬soriasis）是由多致病因素和多基因?qū)е碌穆匝装Y性的皮膚病，銀屑病現(xiàn)在已經(jīng)是皮膚科門(mén)診相對(duì)較為常見(jiàn)的疾病之一。銀屑病的主要的臨床表現(xiàn)是以表皮角質(zhì)層細(xì)胞的增殖和皮損處的炎癥為主要表現(xiàn)。銀屑病的特征性的損害為紅色的丘疹或斑塊上覆蓋多層銀白色的鱗屑，并且伴有不同程度的瘙癢。該病沒(méi)有特效的治療方式，容易復(fù)發(fā)，根治困難，目前 WHO已經(jīng)把銀屑病列為皮膚病領(lǐng)域的頑癥之一。
　　銀屑病的發(fā)病因素非常之多，包括外傷、手術(shù)

2、、陽(yáng)光照射、以及藥物使用等。目前，本病的發(fā)病機(jī)制還沒(méi)有徹底研究清楚。研究者通常認(rèn)為，在銀屑病的發(fā)生中免疫系統(tǒng)異常、炎癥介質(zhì)的產(chǎn)生異常起重要的作用。
　　銀屑病的發(fā)生、發(fā)展是由遺傳因素和環(huán)境因素共同作用引起來(lái)的，而遺傳因素發(fā)揮著更為主要的作用。國(guó)內(nèi)外的研究者通過(guò)使用連鎖分析、外顯子芯片、GWAS、Meta分析以及靶向測(cè)序等大量的研究方法，使得很多銀屑病的易感基因及位點(diǎn)被發(fā)現(xiàn)。然而現(xiàn)在被發(fā)現(xiàn)的位點(diǎn)幾乎都是SNP（單核苷酸多態(tài)性：sin

3、gle nucleotide polymorphism），插入/缺失變異（InDel）是除SNP以外的銀屑病遺傳變異中的一種重要的變異類型。
　　前期我們的團(tuán)隊(duì)通過(guò)使用靶向測(cè)序，發(fā)現(xiàn)了6個(gè)與銀屑病易感性顯著相關(guān)(P<10E-03)的InDels。這6個(gè)InDels分別位于UBLCP1、STAT3、BRD3、PTCHD3、SGSH、NFKBIZ基因上。本次實(shí)驗(yàn)應(yīng)用的是Sequenom平臺(tái)對(duì)前期結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證，并且進(jìn)一步做了銀屑病的基因

4、和表型的關(guān)聯(lián)分析。
　　目的：本次實(shí)驗(yàn)應(yīng)用的是Sequenom平臺(tái)對(duì)前期結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證，并且進(jìn)一步做了銀屑病的基因型和表型的關(guān)聯(lián)分析。所要分析的銀屑病的亞臨床表型包括如下內(nèi)容：發(fā)病年齡、皮損類型、發(fā)病程度以及有無(wú)家族史等。
　　方法：本次研究選取了中國(guó)漢族人群銀屑病樣本2208例和匹配的健康對(duì)照2208例，應(yīng)用Sequenom平臺(tái)，對(duì)前期發(fā)現(xiàn)的6個(gè)與銀屑病易感性相關(guān)的InDels進(jìn)行驗(yàn)證。用 PLINK1.07對(duì)研究結(jié)果的數(shù)據(jù)

5、進(jìn)行分析檢驗(yàn)。之后，合并兩次實(shí)驗(yàn)階段的病例12154例和對(duì)照12114例的臨床信息，做銀屑病的基因型與表型的相關(guān)性分析。
　　結(jié)果：1對(duì)靶向測(cè)序的提示基因驗(yàn)證后，基因 UBLCP1（chr5_158639126）、STAT3（chr17_37729176）、BRD3（chr9_135896602）與銀屑病的發(fā)病有相關(guān)性，最顯著的是 UBLCP1（chr5_158639126）,P=1.69E-4（OR(95％CI)=1.19(1.

6、09-1.30）。然后把靶向測(cè)序結(jié)果和這次驗(yàn)證的結(jié)果進(jìn)行合并并再次分析，得到 UBLCP1的P=2.75E-14，OR(95%CI)=1.16（1.11-1.20）。實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明該基因與銀屑病的發(fā)病顯著相關(guān)。
　　2分析銀屑病表型與UBLCP1基因型的關(guān)系，中國(guó)漢族人的銀屑病的發(fā)病時(shí)間、發(fā)病程度、發(fā)病類型、有無(wú)家族史與基因UBLCP1（chr5_158639126）（P發(fā)病時(shí)間=8.90E-01， OR(95%CI)發(fā)病時(shí)間=0.