中國廣東漢族宮頸癌家系與HLA-Ⅱ類基因多態(tài)性的關聯(lián)性分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、宮頸癌(cervical cancer)是在世界范圍內女性發(fā)病率居于第二位的惡性腫瘤,高危型人乳頭狀瘤病毒(Human papillomavirus,HPV)的感染,是宮頸癌和宮頸上皮內瘤樣病變(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)的重要病因。超過90%的宮頸癌合并HPV的感染,然而大多數(shù)感染HPV的婦女并不發(fā)展成宮頸癌,感染可自然消退;另外,有少數(shù)宮頸癌患者并未合并有HPv的感染。這表明僅有H

2、PV的感染尚不足以導致宮頸癌的發(fā)生,遺傳與環(huán)境因素是宮頸癌發(fā)生的重要誘因。 近年來,國內外廣泛開展了宮頸癌宿主易感性的研究,大多數(shù)研究集中在人類白細胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)復合體。人類的HLA系統(tǒng),定位于第六號染色體短臂6p21.1-21.3,是免疫系統(tǒng)的重要組成部分,具有高度的多態(tài)性,是人類對疾病易感性的主要免疫遺傳學基礎。但到目前為止,對宮頸癌的易感基因和保護基因還未達成共識,而且HL

3、A具有種族和地域的差異。本課題組對廣東漢族人群的先期研究成果(病例-對照研究)顯示:在宮頸癌患者的HLA復合體中,DPB1*1301、DPB1*0202、DQB1*030302、DQB1*050301等位基因頻率較對照組為高,提示可能是廣東漢族人群宮頸癌患者發(fā)病的易感基因。DRB1*110101等位基因和DRB1*13-DQB1*06連鎖單倍型在宮頸癌中的頻率較對照組為低,提示可能對廣東漢族人群具有保護性作用。為了避免傳統(tǒng)的病例-對照研

4、究中由于混雜因素所造成的假陽性,我們在先期研究的基礎上進行基于家系的關聯(lián)性分析,把HLA-Ⅱ類基因作為宮頸癌可能的候選基因進行深入的研究。 材料和方法: 1、調查對象的來源: 收集2003年9月至2007年10月在中山大學附屬第二醫(yī)院婦產科就診的宮癌病人75例,平均年齡為35.1±7.2歲。確定為先證者后,再追蹤其父母和同胞共196人。所有實驗對象均為居住在廣東且自認祖籍為廣東的漢族人群,抽取其外周血3ml。

5、 2、實驗方法: 以PCR-SBT(sequencing based typing,SBT)為主的分型方法對實驗組HLA-Ⅱ類基因進行DNA序列測定和等位基因分型。等位基因頻率采用直接計數(shù)法。使用Arlequin31軟件包進行Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗。采用FBAT軟件對宮頸癌樣本進行基于家系的關聯(lián)分析,將測得的宮頸癌家系的基因型、患病狀態(tài)等輸入軟件。 結果: 1、DPB1、DQB1、DRB1等

6、位基因頻率廣東漢族75例宮頸癌先證者的HLA-Ⅱ類抗原多態(tài)性研究中共檢出78種等位基因,父母及同胞中共檢出72種等位基因。 1)宮頸癌組 宮頸癌組中檢出DPB1 34種等位基因。其中頻率較高的幾種為:DPB1*0501(28.87%),DPB1*020102(14.67%),DPB1*1301(12.00%),DPB1*040101(5.33%);DQB1與DRB1位點分別檢出20和24種等位基因,其中DQB1位點中頻率

7、最高的三種為:DQB1*050201(20.67%),DQB1*030302(14.67%),DQB1*030101(11.33%),DRB1位點中頻率最高的三種為:DRB1*030101(21.33%),DRB1*090102(16.67%),DRB1*150101(10.33%)。 2)父母及同胞組 父母及同胞中DPB1位點有27種等位基因,其中DPB1*0501(28.87%),DPB1*020102(17.24%

8、),DPB1*2101(5.17%),DPB1*030101(4.74%),DPB1*040101(3.02%)的頻率較高。DQB1與DRB1位點分別檢出21和24種等位基因,其中DQB1位點中頻率最高的三種為:DQB1*050201(17.24%),DQB1*030101(14.22%),DQB1*030302(13.34%);DRB1位點中頻率最高的三種為DRB1*030101(18.53%),DRB1*090102(15.09%)

9、,DRB1*120201(11.21%)。 3)FBAT分析結果以加性遺傳模型分析,共發(fā)現(xiàn)4個等位基因可能會增加宮頸癌的發(fā)病風險,包括DQB1*030302(Z=3.463,P=0.0015350)和DQB1*0602(Z=-2.839,P=0.014523)、DRB1*150101(Z=2.002,P=0.035281)、DPB1*1301(Z=2.028,P=0.032577)。 2、DR-DQ連鎖單倍型 1)宮頸癌

10、組宮頸癌組的居于前三位的DR-DQ連鎖單倍型頻率:DRB1*090102-DQB1*030302(12.62%),DRB1*150101-DQB1*060103(10.23%),DRB1*120201-DQB1*030101(6.51%)。 2)父母及同胞組DR-DQ連鎖單倍型頻率最高的為:DRB1*120201-DQB1-03010I/0309(6.22%),DRB1*030101-DQB1*0201(4.33%),DRB1*

11、140101-DQB1*050201(3.02%)。 3)FBAT分析結果以加性遺傳模型分析,DRB1*150101-DQB1*060103(Z=2.132,P=0.032877)與增加宮頸癌的發(fā)病風險有關。 結論: HLA-Ⅱ類基因上的部分等位基因可能是廣東漢族人群宮頸癌的易感基因。DQB1*030302、DQB1*0602、DRB1*150101、DPB1*1301等位基因以及DRB1*150101-DQB1

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