不同甘蔗品種基因組DNA甲基化分析.pdf

1、甘蔗為禾本科甘蔗屬作物，廣泛種植于熱帶和亞熱帶地區(qū)，并作為生產(chǎn)食糖的重要原料，也是廣西的主要經(jīng)濟(jì)作物。本文利用MSAP檢測(cè)8個(gè)甘蔗伸長(zhǎng)期DNA甲基化水平和5個(gè)成熟期品種甲基化水平，并克隆回收部分條帶，研究其與甘蔗農(nóng)藝性狀的之間的關(guān)系。研究結(jié)果如下:
　　1、甘蔗伸長(zhǎng)期甲基化分析表明，11對(duì)引物組獲得了4719條多態(tài)性條帶。其中，非甲基化多態(tài)性條帶4288條，全甲基化多態(tài)性條帶241條，半甲基化多態(tài)性條帶190條。因此，甘蔗基因組C

2、CGG位點(diǎn)發(fā)生甲基化的方式主要是以內(nèi)部胞嘧啶(Cm5CGG)雙鏈甲基化為主。
　　2、成熟期甲基化分析表明，11對(duì)引物組合獲得3519條多態(tài)性條帶，其中，非甲基化多態(tài)3307條，全甲基化帶型171條，半甲基化帶型41條。甘蔗基因組CCGG位點(diǎn)發(fā)生甲基化的方式主要是以內(nèi)部胞嘧啶(Cm5CGG)雙鏈甲基化為主。
　　3、甘蔗伸長(zhǎng)期和成熟期兩個(gè)時(shí)期的甲基化變化情況如下:平均每個(gè)品種擴(kuò)增的半甲基化率從4.02％下降到1.16％，甲基

3、化敏感擴(kuò)增多態(tài)性從9.12％下降到6.02％。
　　4、使用NTSYSpc軟件中UPGMA對(duì)8個(gè)甘蔗品種伸長(zhǎng)期的MSAP中的HpaⅡ酶切數(shù)據(jù)，進(jìn)行聚類分析。桂糖06-1721單獨(dú)成為第一類;柳城05-136和桂糖07-645成為第二類;桂糖04-1001和桂引C1-2003為第三類;桂糖03-1438、桂糖05-3626和桂糖06-244為第四類。用MspⅠ酶切數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析，桂糖06-1721單獨(dú)成為第一類，這與HpaⅡ數(shù)據(jù)分

4、析得到的結(jié)果一樣;柳城05-136也是單獨(dú)成為第二類;桂糖04-1001、桂引C1-2003、桂糖05-3626、桂糖03-1438、桂糖07-645和桂糖06-244為第三類。
　　5、對(duì)5個(gè)甘蔗品種成熟期的MSAP中的HpaⅡ酶切數(shù)據(jù)，進(jìn)行聚類分析。桂糖07-645單獨(dú)成為第一類;柳城05-136和成為第二類;桂糖05-3626成為為第三類;桂引C1-2003和桂糖06-244為第四類。使用MspⅠ酶切數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析，桂糖0