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文檔簡介
1、乳腺癌女性常見的惡性腫瘤之一。研究發(fā)現,DNA甲基化與乳腺癌關系密切,因此研究DNA甲基化在乳腺癌中的發(fā)生機制,獲得有價值的乳腺癌生物學信息,對乳腺癌的臨床治療具有重要的指導意義。本文主要研究了乳腺癌細胞系中全基因組啟動子區(qū)、第一外顯子區(qū)、外顯子區(qū)、內含子區(qū)的DNA甲基化,及其與基因表達之間的關系。通過與正常乳腺細胞系全基因組DNA甲基化比較,發(fā)現癌細胞系中DNA甲基化發(fā)生的變化,找出差異甲基化基因,并對其進行GO分析和KEGG通路分析
2、。
研究結果發(fā)現,乳腺癌細胞系中四個功能區(qū)域的DNA甲基化水平發(fā)生了明顯的改變,并且DNA甲基化水平與基因的表達水平的Pearson相關性說明了不同功能區(qū)域的DNA甲基化對基因表達既有正調控作用又有負調控作用;通過GO分析,我們發(fā)現了差異甲基化基因所參與的分子生物學功能;通過KEGG通路分析;發(fā)現了參與癌癥通路的目標基因,并研究了在正常乳腺細胞系和乳腺癌細胞系中這些基因啟動子區(qū)域的DNA甲基化分布,并推測某些重要基因的異常甲基
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