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1、瘦素基因(leptin,LEP)編碼的蛋白質(zhì)主要參與哺乳動(dòng)物繁殖功能、動(dòng)物體重和機(jī)體能量平衡等方面的調(diào)節(jié)。本研究以南江黃羊(n=267),簡(jiǎn)州大耳羊(n=36),美姑山羊(n=37),藏山羊(n=41)和川南黑山羊(n=30)共5個(gè)山羊品種為試驗(yàn)材料,研究LEP基因單核苷酸的多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP),并分析南江黃羊LEP基因的SNP位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性。主要研究結(jié)果如下:
2、 1.LEP基因在5個(gè)山羊品種中共檢測(cè)到6個(gè)SNP位點(diǎn)(g.117T>C,g.1642G>A,g.2883G>A,g.3053.T>C,g.3190G>A和g.3314T>C)。主要等位基因頻率范圍為0.583~0.987,各位點(diǎn)基因型分布存在顯著性差異。觀測(cè)雜合度和期望雜合度分別為0.026~0.533和0.026~0.497,PIC為0.025~0.370,呈低度或中度多態(tài)性,有較大的選擇潛力??ǚ?x2)檢驗(yàn)表明,LEP基因的6
3、個(gè)SNP位點(diǎn)均處于哈迪-溫伯格平衡狀態(tài)(P>0.05)。
2.LEP基因在5個(gè)山羊品種中總共檢測(cè)到15種單倍型,主要單倍型頻率為0.083~0.244。連鎖不平衡(LD block)分析表明,兩個(gè)培育品種(南江黃羊和簡(jiǎn)州大耳羊)的LEP基因SNP存在明顯的連鎖不平衡。
3.統(tǒng)計(jì)分析表明LEP基因的6個(gè)SNP與南江黃羊生長(zhǎng)性狀存在關(guān)聯(lián)性。在g.117T>C位點(diǎn),TT基因型個(gè)體的24月齡體重和胸圍顯著高于CC基因型個(gè)體(
4、P<0.05)。在g.1642G>A和g.2883G>A位點(diǎn)的GG基因型個(gè)體在出生重(2.38±0.03 kg,2.45±0.05 kg)和2月齡體重(10.59±0.16 kg,10.71±0.26 kg)顯著高于AA基因型或GA基因型個(gè)體(P<0.05)。在g.3053T>C和g.3190G>A位點(diǎn),突變純合基因型個(gè)體的24月齡體長(zhǎng)顯著高于其他基因型個(gè)體(P<0.05)。在g.3314T>C位點(diǎn),TT型個(gè)體出生體重顯著高于其他兩種基
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