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文檔簡介
1、目的:EB病毒(Epstein-Barr Virus,EBV)與人類淋巴瘤的發(fā)生密切相關,其分布具有一定的地域性和人群傾向性,除環(huán)境因素和遺傳因素外,是否存在與EBV陽性淋巴瘤相關的EBV基因變異一直是倍受關注。本研究采用聚合酶鏈反應(Polymerase chain reaction,PCR)結合DNA測序技術檢測山東青島地區(qū)EBV陽性淋巴瘤組織中EBV核抗原1(Epstein-Barr virus nuclear antigen1,
2、EBNA1)編碼基因序列,旨在探討EBNA1編碼基因序列變異在淋巴瘤發(fā)生中的意義,明確其變異是具有地域性抑或腫瘤特異性。
方法:采用原位雜交技術檢測山東省青島市622例淋巴瘤患者腫瘤組織中EBV編碼的小RNA1(EBV-encoded small RNA1,EBER1)以篩選EBV陽性淋巴瘤標本,巢式PCR結合DNA測序檢測EBV陽性淋巴瘤標本中EBNA1編碼基因多態(tài)性。應用DNAStar軟件對EBNA1編碼基因序列檢測結果進
3、行對比分析,與EBV標準株序列比較,根據(jù)EBNA1蛋白487位氨基酸(AA)的變異情況分型;并根據(jù)EBNA3C基因的缺失序列采用PCR技術對EBV陽性淋巴瘤標本進行EBV1/2分型。
結果:①622例淋巴瘤中共有110例檢測到EBER1陽性信號,陽性率為17.68%?;羝娼鹆馨土?Hodgkin's lymphoma,HL)的陽性率為33.33%(35/105),NK/T細胞淋巴瘤的陽性率為78.67%(59/75),彌漫大B
4、細胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)的陽性率為1.34%(5/372)和T細胞淋巴瘤的陽性率為15.71%(11/70)。②EBNA1根據(jù)其C端487位點氨基酸的變化及其它共有突變可分為5種亞型,本研究共檢測到4種亞型,包括V-val變異型,原型P-thr,V-Leu變異型以及P-ala原型,檢出率分別為67.3%(74/110),15.5%(17/110),3.6%(4/110)和10.
5、9%(12/110)。③統(tǒng)計學分析顯示,4種EBNA1亞型在淋巴瘤組織中的分布無顯著性差異(P=0.383);與EBV相關胃癌(EBV-associated gastric carcinoma,EBVaGC)、鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)及健康攜帶者咽漱液(throat washing,TW)相比,EBNA1亞型的分布也無顯著性差異(P>0.05)。④4種淋巴瘤組織中1型EBV、2型EBV以及1+2
6、混合型EBV的分布沒有顯著不同(P=0.089),而淋巴瘤分別與NPC,EBVaGC和TWs比較EBV分型均有顯著性差異(P=0.002,P=0.007,P=0.001)。根據(jù)EBV1/2分型將淋巴瘤分為3組,即type1,type2和type1+2,3組中EBNA1亞型V-val,P-thr,V-leu和P-ala的分布沒有顯著不同(P=0.553)。
結論:①EBV陽性淋巴瘤標本共檢測到V-val,P-thr,V-Leu和
7、P-ala4種EBNA1亞型,V-val是青島地區(qū)淋巴瘤中最為常見亞型,由于該亞型同時也是亞洲地區(qū)最常見的亞型,而此結果與其它地區(qū)的相關報道不同,表明 V-val亞型呈地域相關性。②青島地區(qū)EBV陽性淋巴瘤、NPC、EBVaGC組織和EBV健康攜帶者TWs中,以及4種EBV陽性淋巴瘤間EBNA1亞型的分布均無顯著性差異,表明EBNA1亞型不具有腫瘤特異性,在淋巴瘤的發(fā)生中不具有選擇傾向性,進一步支持其地域相關性特點。③與NPC,EBVa
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