西南矮馬矮小性狀基因SHOX的克隆測序和多態(tài)性研究.pdf

1、本研究以不同類型西南矮馬為研究對象，參考著GenBank中已發(fā)表物種的矮小性狀基因SHOX的序列，利用PCR技術(shù)，首次克隆了7個類型西南馬矮小性狀基因SHOX的部分序列。其中，德保馬的序列提交到了GenBank中，登錄號為:EU556739。此外，對7個類型西南馬的矮小性狀基因序列及核苷酸組成進行了初步研究，同時采用PCR-SSCP技術(shù)和PCR產(chǎn)物直接測序等方法，采用純種設(shè)特蘭矮馬(ST，3只)作為對照組，對各類型西南馬SHOX基因序列

2、進行了多態(tài)性分析。研究結(jié)果表明: 1、克隆所得的序列長度為520bp，包含著CDS的部分序列。 2、通過GenBank中的Blast軟件對此序列進行同源性比較以后發(fā)現(xiàn)，與人的矮小性狀基因SHOX有95％的相似性。并通過DNAman等軟件比較發(fā)現(xiàn)此片段主要是馬矮小性狀基因SHOX的第2外顯子部分。 3、將序列提交到了GenBank，登陸號為EU5567399。 4、西南馬SHOX基因序列核苷酸組成富含GC，

3、且馬與其它物種的SHOX基因密碼子在第2外顯子上核苷酸均偏向使用G和C。 5、PCR-SSCP分析結(jié)果表明，在克隆所得序列上選擇的兩個位點中P2位點出現(xiàn)了多態(tài)性，經(jīng)測序得知在第268處有一個G→A的突變，在431處有一個T→G的突變，由此導(dǎo)致等位基因B變?yōu)榈任换駻。該位點除云南文山馬的優(yōu)勢基因型和優(yōu)勢等位基因為BB型和B外，其余類群馬均為AB型，且X2檢驗結(jié)果表明:云南丘北馬、云南文山馬、云南大理馬、建昌馬和設(shè)特蘭馬在P2位點