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1、目的:在中國(guó)北方人群中識(shí)別阿爾茨海默?。ˋD)的易感基因,并驗(yàn)證其與AD的關(guān)聯(lián)性。
方法:1.研究人群選擇北京AD患者248例,同地區(qū)年齡、性別匹配408例對(duì)照。通過(guò)文獻(xiàn)檢索和生物信息學(xué)分析,篩選出GBP2、BIN1、ADAM12、FRMD4A、SORL1、PICALM、MS4A4E、TOMM40基因及3號(hào)染色體和4號(hào)染色體區(qū)間,共10個(gè)未在中國(guó)人群中進(jìn)行與AD關(guān)聯(lián)性報(bào)道的候選SNPs位點(diǎn)。通過(guò)PCR-HRM(聚合酶鏈反應(yīng)-高
2、分辨率率溶解曲線)技術(shù)并結(jié)合隨機(jī)抽樣方法測(cè)序驗(yàn)證分型結(jié)果的準(zhǔn)確性,對(duì)研究人群進(jìn)行10個(gè)位點(diǎn)的基因分型檢測(cè)。2.使用SPSS統(tǒng)計(jì)軟件及GMDR等軟件分析各位點(diǎn)等位基因、基因型及遺傳模型頻率在兩組的分布,驗(yàn)證候選位點(diǎn)與中國(guó)北方人群AD風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián),并且分析各位點(diǎn)基因、基因型及遺傳模型與AD臨床表型的關(guān)聯(lián)。探索候選位點(diǎn)在AD患者中攜帶ApoE風(fēng)險(xiǎn)基因型與非攜帶組間的基因型頻率差異。
結(jié)果:1.在中國(guó)北方人群中,篩選的10個(gè)位點(diǎn)有3個(gè)與
3、AD關(guān)聯(lián),分別是rs7081208、rs3851179、rs10119(P=0.045,P=0.032,P=0.01)。2.遺傳模型分析中發(fā)現(xiàn):rs1425967單核苷酸多態(tài)性的基因型AG與AD有關(guān)聯(lián)(P=0.002,OR=0.61);rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT、TT、CT+TT與AD存在風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)(P=0.032,OR=4.59;P=0.026,OR=4.68;P=0.026,OR=4.66);rs3851179單核
4、苷酸多態(tài)性的基因型CT、CT+TT與AD風(fēng)險(xiǎn)關(guān)聯(lián)(P=0.01,OR=1.58;P=0.021,OR=1.49);rs10119單核苷酸多態(tài)性的基因型CT、CT+TT與AD患病風(fēng)險(xiǎn)有顯著性關(guān)聯(lián)(P=0.004,OR=1.684;P=0.013,OR=1.158)3.在ApoE風(fēng)險(xiǎn)基因型協(xié)同作用分析發(fā)現(xiàn):rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT+TT在攜帶ApoE基因rs429358單核苷酸多態(tài)性風(fēng)險(xiǎn)基因CT+TT組中多于非攜帶組(
5、P=0.003,OR=11.73)。4.在AD患者臨床變量癡呆程度分析中發(fā)現(xiàn):rs2221154單核苷酸多態(tài)性T等位基因與癡呆程度有顯著性關(guān)聯(lián)(P=0.003);rs1425967單核苷酸多態(tài)性的共顯模型中基因型AG與GG與癡呆程度相關(guān)(P=4.39×10-4,P=0.002);rs7081208單核苷酸多態(tài)性的等位基因G及基因型GG與癡呆程度有顯著性關(guān)聯(lián)(P=0.01,P=0.01);rs720099等位基因C及顯性模型中基因型CC+
6、CT與癡呆程度也有顯著性關(guān)(P=2.24×10-16,P=0.038)。5.基因交互作用分析提示:?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs10119 CC或CT-rs3851179 CC或C基因間的互作關(guān)系明顯,病例組患AD的風(fēng)險(xiǎn)顯著高于對(duì)照組。6.危險(xiǎn)基因型累積效應(yīng)分析發(fā)現(xiàn):?jiǎn)魏塑账岫鄳B(tài)性rs7081208、rs3851179與rs10119隨著危險(xiǎn)基因型數(shù)目的增多,病例組和對(duì)照組間含有的危險(xiǎn)基因型數(shù)目的越多,個(gè)體患AD的風(fēng)險(xiǎn)越大(OR值由1.79增大2.
7、09再到4.94)。
結(jié)論:1.FRMD4A基因rs7081208、PICALM基因rs3851179與TOMM40基因rs10119可能是中國(guó)北方人群的AD易感基因。2.rs1425967單核苷酸多態(tài)性的基因型AG、rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT、TT、CT+TT可能會(huì)增加AD的患病風(fēng)險(xiǎn)。3.ApoE基因rs429358單核苷酸多態(tài)性風(fēng)險(xiǎn)基因CT+TT會(huì)增加rs11244841單核苷酸多態(tài)性的基因型CT+TT
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