胰腺導管腺癌lncRNAs差異表達譜的篩選及功能分析.pdf

1、復旦大學博士學位論文胰腺導管腺癌lncRNAs差異表達譜的篩選及功能分析姓名：童漢興申請學位級別：博士專業(yè)：外科學指導老師：靳大勇教授導師組成員：樓文暉教授王單松教授陸維祺教授20140402中文摘要第一部分胰腺導管腺癌IncRNAs差異表達譜的篩選及驗證【背景】胰腺導管腺癌是一種難治性惡性腫瘤。早期缺乏特異性癥狀和體征，一旦出現(xiàn)癥狀和體征，腫瘤多數(shù)已進展至晚期。另外其復雜的解剖特點和獨特嗜神經(jīng)特性也決定了該腫瘤根治性手術(shù)切除困難、切除

2、率較低，切即使手術(shù)切除，文獻報道其5年生存率也不足5％。胰腺癌對放化療不敏感，一旦復發(fā)轉(zhuǎn)移，更缺乏有效的治療手段。因此為了改善胰腺癌的預后，亟待開發(fā)胰腺癌早期診斷的分子標記物和治療靶點。雖然近20年來，關(guān)于胰腺癌的遺傳分子研究取得很大進展，但并未開發(fā)出有效的診斷標記物和治療靶點。近年來研究發(fā)現(xiàn)非編碼RNA廣泛參與正常生理及病理生理過程的調(diào)控，和腫瘤的關(guān)系密切。其中長鏈非編碼RNA(10ngnoncodingRNA，lncRNA)在惡性腫

3、瘤中的研究取得很多令人鼓舞的的進展，該類研究也極大的豐富了表觀遺傳研究的內(nèi)容。lncRNAs在胰腺癌中的研究剛剛起步。因此深入研究lncRNAs在胰腺癌發(fā)生發(fā)展中的作用，將有助于深入認識胰腺癌發(fā)生發(fā)展的機制，為改善胰腺癌診治水平開辟新思路。【目的】研究lncRNAs在胰腺癌組織及癌旁組織中的表達特征，預測差異表達lncRNAs在胰腺癌組織中基因異常表達的調(diào)控作用?！痉椒ā坎捎肏umanLncRNAArrayv20(8x60K，Array

4、star)芯片對6對胰腺癌組織及癌旁組織標本中的轉(zhuǎn)錄本進行高通量篩查，確定胰腺癌中的lncRNAs和rnRNAs差異表達譜。然后采用qPCR在61例胰腺導管腺癌、20例胰腺漿液性囊腺瘤、14例實性假乳頭狀瘤、10例神經(jīng)內(nèi)分泌瘤及12例十二指腸乳頭腺癌的癌組織和癌旁組織中對5個差異表達的lncRNAs，AC090110131、CXCR2P1、PPY2、HOXAll86、DKFZp434J0226進行驗證。采用GO、Pathway及編碼非編

5、碼基因共表達網(wǎng)絡等生物信息學方法對差異表達mRNAs的功能及差異表達lncRNAs對胰腺癌組織中基因異常表達的調(diào)控作用進行分析，并為進一步的研究奠定基礎?！窘Y(jié)果】芯片雜交數(shù)據(jù)分析顯示，在6對胰腺癌組織和癌旁組織之間，表達差異倍數(shù)2，p≤O05的IncRNAs有291個，其中上調(diào)的53個，下調(diào)的76個。聚類分析顯示，291個差異表達的IncRNAs能夠區(qū)分癌組織和癌旁組織。其中91個lncRNAs在6對標本中的變化與總體結(jié)果一致，其中34