用16SrDNA序列分析方法研究嬰幼兒感染性腹瀉病糞便菌群變化.pdf

1、本文使用細(xì)菌16SrDNA序列分析方法，對(duì)2006年8月至9月間在山西省獲得的11名分離不到常見(jiàn)病原體的嬰幼兒感染性腹瀉病人的糞便標(biāo)本細(xì)菌菌群變化進(jìn)行了研究。通過(guò)對(duì)11名患者的25份標(biāo)本進(jìn)行16SrDNA擴(kuò)增、克隆、序列分析，共得到4059條有效序列。使用本室構(gòu)建的細(xì)菌16S rRNA基因共有序列數(shù)據(jù)庫(kù)(RCSD)進(jìn)行比對(duì)后，得到這些糞便標(biāo)本的菌群組成動(dòng)態(tài)分布情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，在11名患者入院第一天的糞便標(biāo)本中，有9例患者的糞便以鏈球菌為

2、優(yōu)勢(shì)菌群，1例以大腸桿菌為優(yōu)勢(shì)菌，1例以克雷伯菌為優(yōu)勢(shì)菌。在9例以鏈球菌為優(yōu)勢(shì)菌群的病例中，3例患者糞便標(biāo)本的優(yōu)勢(shì)菌群為牛鏈球菌，且隨著臨床表現(xiàn)好轉(zhuǎn)，糞便標(biāo)本的牛鏈球菌消失。同時(shí)，我們還從上述標(biāo)本分離到優(yōu)勢(shì)菌，和16SrDNA序列分析的結(jié)果基本一致。細(xì)菌染色體DNA酶切圖譜的脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulse field gel electrophoresis)分析結(jié)果發(fā)現(xiàn)，從一個(gè)患者糞便標(biāo)本分離到的優(yōu)勢(shì)菌的酶切圖譜基本一致。結(jié)果提示，以鏈球菌