五大湖三角帆蚌遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析.pdf

1、運(yùn)用線粒體DNA COI和Cytb、ITS-1序列片段、ISSR，分別對(duì)我國(guó)五大淡水湖：洞庭湖(DT)、太湖(TH)、巢湖(CH)、洪澤湖(HZ)，及鄱陽(yáng)湖內(nèi)進(jìn)賢(PJ)、余干(PY)、珠湖(PZ)、都昌(PD)、湖口(PH)、永修(YX)合計(jì)10個(gè)群體三角帆蚌的遺傳多樣性和親緣關(guān)系進(jìn)行了研究。 對(duì)10個(gè)群體三角帆蚌69個(gè)個(gè)體線粒體DNA COI和Cytb進(jìn)行PCR擴(kuò)增、序列測(cè)定，獲得同源基因序列。同源基因序列分析顯示，mtDN

2、A COI Cytb基因片段中，A+T含量都明顯大于G+C含量。mtDNA COI和Cytb中分別檢測(cè)到42個(gè)和40個(gè)單倍型，332個(gè)和329個(gè)核苷酸多態(tài)位點(diǎn)。mtDNA COI和Cytb基因序列的遺傳距離表明，五大湖群體間遺傳距離較遠(yuǎn)，群體之間的遺傳距離分別為0.0111到0.0422之間和0.O101到0.0412之間，各為獨(dú)立的種群；鄱陽(yáng)湖六個(gè)點(diǎn)群體間遺傳距離很近，分別僅為0.0021到0.0073之間和0.0012到0.0051

3、之間，為一個(gè)種群。mtDNA COI和Cytb分子系統(tǒng)樹(shù)都顯示，鄱陽(yáng)湖6個(gè)群體聚在一起，并與巢湖群體親緣關(guān)系相近，然后鄱陽(yáng)湖、巢湖這二個(gè)群體再和太湖群體聚在一起。洞庭湖群體和洪澤湖群體親緣關(guān)系相近，單獨(dú)為一支。 對(duì)10個(gè)群體三角帆蚌78個(gè)個(gè)體核糖體DNA基因轉(zhuǎn)錄間隔子ITS-1進(jìn)行PCR擴(kuò)增、序列測(cè)定，獲得78條長(zhǎng)度為430bp的同源序列。同源基因序列分析顯示，五大淡水湖10個(gè)群體三角帆蚌78條ITS-1序列片段，G+C的含量都

4、明顯高于A+T的含量。鄱陽(yáng)湖三角帆蚌的核苷酸多態(tài)性指數(shù)最高，而巢湖的核苷酸多樣性指數(shù)最低?；贗TS-1序列片段的遺傳距離表明，鄱陽(yáng)湖內(nèi)六個(gè)點(diǎn)群體間遺傳距離很小，在0.0071到0.0092之間。五大湖間三角帆蚌群體遺傳距離較遠(yuǎn)，在0.0752到0.1381之間。ITS-1序列片段構(gòu)建系統(tǒng)樹(shù)顯示，鄱陽(yáng)湖6個(gè)群體聚在了一起為單獨(dú)一支，并與巢湖群體親緣關(guān)系相近。洞庭湖群體和洪澤湖群體親緣關(guān)系相近，單獨(dú)為一支。太湖群體從鄱陽(yáng)湖、巢湖群體分離開(kāi)

5、來(lái)，單獨(dú)為一支。 運(yùn)用ISSR對(duì)10個(gè)群體三角帆蚌進(jìn)行研究。利用篩選獲得的5條ISSR引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，POPGENE結(jié)果分析。計(jì)算Na、Ne、H和I各項(xiàng)數(shù)值，發(fā)現(xiàn)鄱陽(yáng)湖的遺傳多樣性最高，洪澤湖群體最低。遺傳距離計(jì)算表明，鄱陽(yáng)湖內(nèi)六個(gè)點(diǎn)群體間遺傳距離相對(duì)較近，遺傳距離在0.0143到0.0561之間，五大湖間群體遺傳距離相對(duì)較遠(yuǎn)，遺傳距離在0.1637到0.3341之間。系統(tǒng)樹(shù)構(gòu)建顯示，鄱陽(yáng)湖6個(gè)群體聚在一起，并與巢湖群體親緣