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文檔簡介
1、利用北美Epioblasma capsaeformis和中歐Margaritifera margaritifera L.兩種淡水雙殼類的20對微衛(wèi)星引物對江西青嵐湖五種淡水蚌群體的基因組DNA進行了PCR擴增,篩選出8對多態(tài)性較高的引物,并用這8個微衛(wèi)星座位分別對三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)、褶紋冠蚌(Cristaria plicata)、洞穴麗蚌(Lamprotula caveata)、射線裂脊蚌(Schistod
2、esmus lampreyanus)和中國尖嵴蚌(Acuticosta chinensis)五種蚌類群體的等位基因頻率、遺傳雜合度、有效等位基因數(shù)、多態(tài)信息含量等進行了遺傳多樣性分析,根據(jù)標準遺傳距離對這五種蚌進行了聚類分析。并進一步利用PCR法分離了三角帆蚌的微衛(wèi)星標記。主要研究結(jié)果如下:
1、五種蚌類群體的平均等位基因數(shù)為2.8750~4.000,平均觀測雜合度(Ho)為0.4417~0.6333,平均期望雜合度(He
3、)為0.4430~0.5706,平均多態(tài)信息含量(PIC)為0.368~0.498,五種蚌類群體表現(xiàn)出較高的遺傳多樣性。
2、有多個座位在不同蚌類群體中偏離哈代-溫伯格平衡。微衛(wèi)星位點Ecap6和MarMa3116僅在射線裂脊蚌中擴增出單一條帶,可以作為鑒定射線裂脊蚌的特異性微衛(wèi)星標記。
3、五種蚌類群體間的遺傳距離在0.6228與1.4724之間,三角帆蚌和褶紋冠蚌之間的遺傳距離最大,射線裂脊蚌和洞穴麗蚌之
4、間的遺傳距離最小。
4、用PCR法從三角帆蚌基因組DNA中篩選微衛(wèi)星切實可行,而且避免了同位素污染,一般實驗室即可滿足實驗條件。
5、運用PCR法在三角帆蚌的小片段基因組文庫中能快速篩選含微衛(wèi)星序列的重組陽性克隆,對篩選得到的31個陽性克隆進行測序,結(jié)果獲得33個微衛(wèi)星序列,其中perfect(完美型)25個,占75.8%;imperfect(非完美型)5個,占15.1%;compound(混合型)3個,占9
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