蛋白質(zhì)指紋圖譜和生物信息學(xué)在乳腺癌中的研究.pdf

1、目的:本課題旨在應(yīng)用SELDI蛋白質(zhì)指紋圖譜和生物信息學(xué)技術(shù)從血清中篩選乳腺癌蛋白質(zhì)腫瘤標(biāo)志物并構(gòu)建檢測模型(pattern);建立組織蛋白質(zhì)指紋圖譜的檢測方法從而尋找乳腺癌/正常乳腺組織間的差異表達(dá)蛋白質(zhì);并利用生物信息學(xué)方法對乳腺癌cDNA微陣列數(shù)據(jù)進(jìn)行分析.結(jié)論:1.與H4、WCX2芯片相比,CM10芯片的變異系數(shù)更大,具有更好的穩(wěn)定性和可重復(fù)性.2.3932m/z和5635m/z兩個蛋白質(zhì)峰組合所構(gòu)建的模型能達(dá)到鑒別乳腺癌與健康

2、人的最佳檢測效果,總準(zhǔn)確率87.2％.3.2489、2976、16356、2024、2597和3443m/z六個蛋白質(zhì)峰組合所構(gòu)建的模型能達(dá)到鑒別乳腺癌和乳腺良性疾病的最佳檢測效果,總準(zhǔn)確率80.8％.4.2565、4073、40300、2160和2685m/z五個蛋白質(zhì)峰組合所構(gòu)建的模型能達(dá)到預(yù)測乳腺癌患者有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的最佳效果,總準(zhǔn)確率87.3％.5.3932m/z和5635m/z這兩個蛋白質(zhì)峰有望成為提示乳腺癌術(shù)后復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移的候

3、選標(biāo)志物,值得進(jìn)一步研究.擴(kuò)大樣本量和延長隨防時間將有助于明確結(jié)果.6.在組織蛋白質(zhì)指紋圖譜檢測的方法學(xué)探索中發(fā)現(xiàn):U<,7>SU<,2>裂解液具有較好的裂解效果;裂解液中加入蛋白酶抑制劑合劑能改善指紋圖譜檢測結(jié)果.7.批到乳腺癌/正常乳腺組織間19個差異表達(dá)蛋白,其中9109、17790、11730、12455、9974和11655m/z6個蛋白質(zhì)峰的差異最顯著.8.15869m/z在組織、血清中同時存在,且具有相同的表達(dá)趨勢.9.從