版權(quán)說(shuō)明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請(qǐng)進(jìn)行舉報(bào)或認(rèn)領(lǐng)
文檔簡(jiǎn)介
1、黃芪(Astragalus membranaceus(Fisch.) Bge.)是中國(guó)北方的重要藥用植物,廣泛應(yīng)用于臨床配方,具有強(qiáng)心、抗心肌缺血、提高免疫力、降糖、抗衰老、保護(hù)臟器等多種藥理作用。黃芪的藥效活性成分主要有多糖,皂苷、黃酮等次生代謝產(chǎn)物。現(xiàn)在黃芪次生代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)主要來(lái)源于植物材料的直接浸提,但植物次生代謝產(chǎn)物的低產(chǎn)量一直是一個(gè)很難解決的重要問(wèn)題。由于缺乏基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),黃芪具有生物活性的次生代謝物質(zhì)合成途徑未知。次
2、生代謝生物合成途徑的候選基因和重要調(diào)控因子的鑒定,將會(huì)有助于理解次生代謝產(chǎn)物生物合成的途徑。
為了使黃芪次生代謝途徑能從正常的代謝背景中突出,并被捕捉到進(jìn)行研究。本研究利用正交試驗(yàn)設(shè)計(jì),以黃芪多糖含量、黃芪皂苷含量、黃芪黃酮含量為衡量指標(biāo),對(duì)調(diào)控相應(yīng)代謝途徑的誘導(dǎo)子進(jìn)行了篩選。正交試驗(yàn)結(jié)果表明,黃芪多糖代謝途徑的最佳誘導(dǎo)子是硝酸銀溶液,最佳處理部位是地下部分,最佳處理時(shí)間是6-9d,最佳多糖含量變化檢測(cè)部位是黃芪根部。黃芪皂苷
3、代謝途徑的最佳誘導(dǎo)子是茉莉酸甲酯和內(nèi)生菌發(fā)酵液,處理部位是地下部位,最佳處理時(shí)間是3d,最佳皂苷含量變化檢測(cè)部位是黃芪根部。黃芪黃酮次生代謝途徑最佳的誘導(dǎo)子是硝酸銀溶液,最佳處理部位是地下部分,最佳處理時(shí)間是9d,最佳黃酮含量變化檢測(cè)部位是葉片。
同時(shí)本研究利用454/Roche GS FLX測(cè)序技術(shù)對(duì)黃芪植株根、莖、葉等比例總RNA混樣進(jìn)行了1/2板的轉(zhuǎn)錄組從頭測(cè)序。這1/2板的測(cè)序共得到742721條高質(zhì)量reads,平均
4、長(zhǎng)度413bp,約86%的reads參與了拼接,拼接的N50長(zhǎng)度為1205。通過(guò)比對(duì)共得到9893個(gè)unigene。全部unigene通過(guò)BLASTX軟件和三大公共數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),9732個(gè)unigene被成功注釋,注釋率為98.37%。利用KEGG對(duì)unigene進(jìn)行功能分類和代謝通路分析,其中2877個(gè)unigene歸入45條代謝路徑。在參與黃芪生物活性物質(zhì)代謝的多糖代謝途徑中找到36條unigene,皂苷和黃酮相關(guān)的代謝途徑中找到68
5、條相關(guān)的unigene。
在黃芪轉(zhuǎn)錄組12880個(gè)轉(zhuǎn)錄本中發(fā)現(xiàn)1729個(gè)SSR位點(diǎn),平均距離是7.97kb,包含了從單核苷酸類型到六核苷酸的六種不同類型,核心重復(fù)序列127種。黃芪基因組測(cè)序還沒(méi)有完成,然而可以利用全基因組測(cè)序的親緣關(guān)系較近大豆(Glycine max)、蒺藜苜蓿(Medicagotruncatula)、百脈根(Lotus japonicus)的基因組序列作參考對(duì)黃芪(Astragalusmembranaceu
6、s)轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行基因模型預(yù)測(cè)分析。與蒺藜苜蓿比對(duì)上的基因數(shù)目是2039條,有21727個(gè)轉(zhuǎn)錄模型,堿基相似度是90.14%;和大豆比對(duì)上的基因數(shù)是1948條,有36864個(gè)轉(zhuǎn)錄模型,堿基相似度是90.40%;和百脈根比對(duì)上的基因數(shù)是1003條,有10056個(gè)轉(zhuǎn)錄模型,堿基相似度是89.77%。以蒺藜苜?;蚪M為參考預(yù)測(cè)的可變剪切位點(diǎn)是290種類型,以大豆基因組為參考預(yù)測(cè)的可變剪切位點(diǎn)有284種類型,以百脈根基因組為參考預(yù)測(cè)的可變剪切位點(diǎn)有
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無(wú)特殊說(shuō)明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請(qǐng)下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請(qǐng)聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁(yè)內(nèi)容里面會(huì)有圖紙預(yù)覽,若沒(méi)有圖紙預(yù)覽就沒(méi)有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫(kù)僅提供信息存儲(chǔ)空間,僅對(duì)用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護(hù)處理,對(duì)用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對(duì)任何下載內(nèi)容負(fù)責(zé)。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當(dāng)內(nèi)容,請(qǐng)與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準(zhǔn)確性、安全性和完整性, 同時(shí)也不承擔(dān)用戶因使用這些下載資源對(duì)自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 轉(zhuǎn)錄組與代謝組合結(jié)合揭示黃瓜黑刺中次生代謝物質(zhì)的合成及調(diào)控途徑.pdf
- 黃芪的代謝組學(xué)研究.pdf
- 丹參WRKY轉(zhuǎn)錄組分析及其在次生代謝物生物合成途徑上的調(diào)控研究.pdf
- 誘導(dǎo)子及光質(zhì)對(duì)半夏生長(zhǎng)與次生代謝影響研究.pdf
- 牛樟芝MVA途徑中基因克隆及轉(zhuǎn)錄組、代謝組研究.pdf
- 轉(zhuǎn)錄組篩選調(diào)控脂肪儲(chǔ)存基因.pdf
- 誘導(dǎo)子對(duì)黃芪愈傷組織生長(zhǎng)及代謝的影響.pdf
- 基于紫外誘導(dǎo)銀杏葉次生代謝產(chǎn)物及其差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf
- 基于光酶誘導(dǎo)的桑葉次生代謝產(chǎn)物及其差異蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf
- 姜黃次生代謝產(chǎn)物生理調(diào)控研究.pdf
- 稻縱卷葉螟轉(zhuǎn)錄組及幾丁質(zhì)代謝途徑和抗藥性基因鑒定.pdf
- 真菌誘導(dǎo)子對(duì)鐵皮石斛原球莖生長(zhǎng)及次生代謝產(chǎn)物的影響.pdf
- 桑螟性腺提取物的GC-MS分析及低溫誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄組和代謝組學(xué)研究.pdf
- 轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)及代謝組學(xué)在腎臟移植中的應(yīng)用研究.pdf
- 基于高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與植物代謝組學(xué)技術(shù)研究遠(yuǎn)志皂苷生物合成途徑.pdf
- 紫外誘導(dǎo)對(duì)圓錐鐵線蓮次生代謝的影響及其差異蛋白組學(xué)研究.pdf
- 黃芪地上部分化學(xué)成分及代謝組學(xué)研究.pdf
- β-catenin調(diào)控小鼠腎臟發(fā)育的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究.pdf
- 基于代謝組學(xué)技術(shù)的黃芪抗心衰作用機(jī)制研究.pdf
- 鱖與草魚(yú)攝食調(diào)控轉(zhuǎn)錄組學(xué)比較研究.pdf
評(píng)論
0/150
提交評(píng)論