大腸癌組織、腺瘤組織和正常黏膜組織的基因表達譜分析.pdf

1、目的：本研究的主要目的是通過建立具有組織特異性的大腸癌基因表達譜，從轉錄組整體水平尋找大腸腫瘤組織、腺瘤組織與正常組織之間的基因表達模式差異，發(fā)現(xiàn)用于預防和早期檢測的候選分子標志物以及基因治療的可能靶點。 方法：利用包含47，000個轉錄本及變異體的AffymetrixU133plus2.0全基因組芯片篩選大腸癌組織、腺瘤組織與正常組織之間差異表達基因；運用生物信息學手段對差異表達基因進行功能分類，以發(fā)現(xiàn)在大腸癌的發(fā)生中起重要作

2、用的基因。 結果：1、篩得大腸癌相關基因和ESTs2340個(占基因和ESTs總數(shù)的4.28％)，其中：大腸癌組表達上調(diào)者609個(占基因和ESTs總數(shù)的1.12％)；大腸癌組表達下調(diào)者1731個(占基因和ESTs總數(shù)的3.16％) 2、篩得早期大腸癌相關基因和ESTs726個(占基因和ESTs總數(shù)的1.32％)，其中：大腸癌組與腺瘤組共同表達上調(diào)者133個(占基因和ESTs總數(shù)的0.24％)；大腸癌組與腺瘤組共同表達下

3、調(diào)者593個(占基因和ESTs總數(shù)的1.08％) 3、對篩得之大腸癌相關基因和早期大腸癌相關基因進行了功能分類，得到所參與基因的分子功能及生物學過程 大腸癌相關基因所參與的功能類別包括細胞生長和/或維持、對外刺激反應、信號轉導、免疫應答、蛋白質(zhì)代謝、堿基、核苷、核苷酸和核酸代謝等 早期大腸癌相關基因所參與的功能類別包括細胞生長和/或維持、信號轉導、蛋白質(zhì)代謝、對外刺激反應、堿基、核苷、核苷酸和核酸代謝、生物合成等

4、 大腸癌相關基因和早期大腸癌相關基因中，參與細胞生長和/或維持功能的基因占參與分類基因的比例最大，為最大的一組功能基因 4、篩選出5個在腺瘤組織及腫瘤組織中都升高表達8倍以上的基因(CADPS，F(xiàn)ABP6，LCN2，CHRM3，CLDN2)，其編碼產(chǎn)物為分泌性蛋白或膜表面蛋白，作為早期檢測的候選分子標志物以及基因治療的可能靶點 結論：在大腸癌發(fā)生的早期階段就有多個基因表達的異常開啟(活化)或關閉(失活)，通過所編