豬肺泡巨噬細(xì)胞系中等位基因特異性表達(dá)調(diào)控的生物信息學(xué)分析.pdf

1、豬肺泡巨噬細(xì)胞(PAM)作為機(jī)體重要的免疫細(xì)胞，在抵抗病原入侵和免疫應(yīng)答方面發(fā)揮著重要的作用。有研究表明等位基因的特異性表達(dá)與某些易感疾病的發(fā)生緊密相關(guān)，但是在PAM細(xì)胞中探究等位基因特異性表達(dá)與疾病、免疫相關(guān)的進(jìn)展還不是很多，并且關(guān)于等位基因特異性表達(dá)的調(diào)控機(jī)制研究的也不是很透徹。因此，本論文將圍繞豬肺泡巨噬細(xì)胞系3D4/21在受到Poly(I∶C)刺激前后等位基因的特異性表達(dá)情況以及可能受到的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因素，如轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、組蛋白修飾

2、以及單倍型染色質(zhì)交互差異等方面展開分析，主要結(jié)果如下:
　　基于RNA-seq數(shù)據(jù)，分別鑒定出PAM細(xì)胞系3D4/21在受到Poly(I∶C)刺激和未刺激情況下具有偏好性表達(dá)的等位基因，經(jīng)過綜合比較，發(fā)現(xiàn)有一些與病原感染、免疫應(yīng)答相關(guān)的等位基因在刺激后呈現(xiàn)出了不同的表達(dá)偏好性并且其總的表達(dá)量相比于未刺激的情況下顯著升高，我們推測這些基因含有抵抗病原體入侵的相關(guān)突變，可作為候選的疾病抗性基因進(jìn)行下步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。為了進(jìn)一步理解等位基因不