豬肺泡巨噬細胞系中等位基因特異性表達調控的生物信息學分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、豬肺泡巨噬細胞(PAM)作為機體重要的免疫細胞,在抵抗病原入侵和免疫應答方面發(fā)揮著重要的作用。有研究表明等位基因的特異性表達與某些易感疾病的發(fā)生緊密相關,但是在PAM細胞中探究等位基因特異性表達與疾病、免疫相關的進展還不是很多,并且關于等位基因特異性表達的調控機制研究的也不是很透徹。因此,本論文將圍繞豬肺泡巨噬細胞系3D4/21在受到Poly(I∶C)刺激前后等位基因的特異性表達情況以及可能受到的轉錄調控因素,如轉錄因子結合、組蛋白修飾

2、以及單倍型染色質交互差異等方面展開分析,主要結果如下:
  基于RNA-seq數據,分別鑒定出PAM細胞系3D4/21在受到Poly(I∶C)刺激和未刺激情況下具有偏好性表達的等位基因,經過綜合比較,發(fā)現有一些與病原感染、免疫應答相關的等位基因在刺激后呈現出了不同的表達偏好性并且其總的表達量相比于未刺激的情況下顯著升高,我們推測這些基因含有抵抗病原體入侵的相關突變,可作為候選的疾病抗性基因進行下步實驗驗證。為了進一步理解等位基因不

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