硒蛋白生物信息二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建.pdf

1、硒蛋白生物信息二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)是第一個(gè)以硒蛋白為主的生物信息數(shù)據(jù)庫(kù).構(gòu)建目的是收集硒蛋白及其基因的序列數(shù)據(jù),方便硒蛋白的核酸序列數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)的共享,為公眾提供服務(wù),同時(shí)為下一步的研究打下基礎(chǔ).在硒蛋白生物信息二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)的整個(gè)構(gòu)建過程中,使用了面向?qū)ο蠹夹g(shù)進(jìn)行分析與設(shè)計(jì).并結(jié)合軟件工程中的理論,注重對(duì)軟件架構(gòu)和設(shè)計(jì)模式的考慮.數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)使用核酸序列和蛋白質(zhì)序列兩個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)來分別管理核酸和蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù).使用JSP/JavaBeans技術(shù)開

2、發(fā)數(shù)據(jù)庫(kù)應(yīng)用程序.其中,數(shù)據(jù)錄入程序采用C/S架構(gòu),負(fù)責(zé)將EMBL和Swiss-Prot格式的文件導(dǎo)入到數(shù)據(jù)庫(kù)中.數(shù)據(jù)訪問部分采取B/S架構(gòu),使用JSP Model 2模式,提供WWW服務(wù).在程序設(shè)計(jì)過程中通過分離表示和業(yè)務(wù),有效地降低了程序的耦合性,保證了程序的可維護(hù)性.討論并分析了在構(gòu)建生物信息二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)中可能會(huì)遇到的一些具有共性的問題:數(shù)據(jù)地自動(dòng)獲取是第一個(gè)問題,該文給出了初步的設(shè)計(jì)思路:EJB是在企業(yè)級(jí)應(yīng)用程序中常用地一項(xiàng)技術(shù),