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文檔簡介
1、 目的 以PTEN為靶點(diǎn)比較人膠質(zhì)瘤細(xì)胞SWO38及其克隆亞系SWOZ1和SWOZ2在基因水平表達(dá)的差異,探討膠質(zhì)瘤異質(zhì)性的分子機(jī)制。
方法 (1) 應(yīng)用RT-PCR法擴(kuò)增人膠質(zhì)瘤細(xì)胞SWO38及SWOZ1和SWOZ2中的PTEN基因,電泳帶灰度測定分析。(2) PCR-SSCP法檢測SWO38及SWOZ1和SWOZ2中PTEN基因突變情況。(3) 將SWO38及SWOZ1和SWOZ2中擴(kuò)增的PTEN基因進(jìn)行測序和BLAST
2、比對(duì)分析,確定有無突變及突變的位置和類型,比較三者間的差異。
結(jié)果 (1) PTEN基因在人膠質(zhì)瘤細(xì)胞SWO38及SWOZ1、SWOZ2中均有表達(dá),且表達(dá)量各不相同,SWO38表達(dá)量最多,SWOZ2次之,SWOZ1表達(dá)量最少。(2) PCR-SSCP檢測未發(fā)現(xiàn)SWO38及SWOZ1、SWOZ2中的PTEN基因有突變。(3)測序結(jié)果顯示SWO38及SWOZ1、SWOZ2三者的PTEN基因編碼序列長度相同,堿基組成及排列順序亦完全
3、相同;此序列經(jīng)BLAST比對(duì)后發(fā)現(xiàn)與數(shù)據(jù)庫中4條序列完全匹配,同一性達(dá)100%,其相似性分?jǐn)?shù)值(S)最大:Score=2403 bits(1212),期望值(E)最?。篍xpect=0.0,這4條序列均為野生型PTEN的mRNA序列,含有完整的1209bp的編碼區(qū)序列;ORF finder比對(duì)結(jié)果顯示此序列編碼的氨基酸序列與野生型PTEN編碼的氨基酸序列相同。
結(jié)論 (1) 人膠質(zhì)瘤細(xì)胞SWO38及SWOZ1、SWOZ2中,P
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