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1、東南大學(xué)碩士學(xué)位論文基于生物芯片的高通量DNA甲基化檢測方法的研究姓名:武志祥申請學(xué)位級別:碩士專業(yè):生物醫(yī)學(xué)工程指導(dǎo)教師:陸祖宏20080407中文摘要物芯片的優(yōu)勢引入到MSMLPA中,探討一種基于生物芯片的MsMLPA。針對被檢測的甲基化DNA,設(shè)計和合成了兩個寡核苷酸部分,其中一個部分含有一個大約20bp左右的密碼區(qū)(Tag區(qū)),可與通用芯片上特定序列的寡核苷酸探針互補雜交。探針的兩個寡核苷酸雜交序列均與目標序列互補,其末端都連有
2、相同的PCR引物。且要求設(shè)計的MSMLPA的探針要有甲基化敏感的限制性內(nèi)切酶BstUI(CG£G)的識別位點。經(jīng)探針和目標序列雜交后,降低反應(yīng)體系溫度,并向其中加入連接酶和BstUI,若原樣本DNA中含有BstUI識別的非甲基化的位點,則非甲基化探針的兩個寡核苷酸部分不能連接,而甲基化的探針順利連接不被切割,在隨后的PCR反應(yīng)中只有兩個寡核苷酸部分連接后的探針才能被擴增。最后通過芯片分析擴增片段,確定待研究位點的甲基化情況。在這項技術(shù)中
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