鴨-魚(yú)混養(yǎng)場(chǎng)養(yǎng)殖環(huán)境抗菌藥物耐藥基因污染及微生物群落特征.pdf_第1頁(yè)
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1、在廣東乃至整個(gè)華南地區(qū),由于水系發(fā)達(dá),大部分地區(qū)是以鴨-魚(yú)混養(yǎng)模式為主。在養(yǎng)殖過(guò)程中,大量的抗菌藥物被用于促生長(zhǎng)和防治疾病,導(dǎo)致動(dòng)物源性致病菌的耐藥性越來(lái)越嚴(yán)重,這些攜帶有耐藥基因(ARGs)的細(xì)菌經(jīng)排泄物等途徑未經(jīng)處理就進(jìn)入環(huán)境土壤、地表、地下水體中,成為環(huán)境中抗生素耐藥基因的主要來(lái)源,而ARGs作為一種潛在的環(huán)境污染物,受到了人們的廣泛關(guān)注。
  本論文選擇三個(gè)廣東地區(qū)典型的鴨魚(yú)混養(yǎng)型養(yǎng)殖場(chǎng),按一年四個(gè)季度連續(xù)四次采集養(yǎng)殖場(chǎng)周

2、邊環(huán)境樣品(土壤、底泥、水),通過(guò)熒光定量的方法連續(xù)監(jiān)測(cè)其耐藥基因豐度;以及通過(guò)16S rDNA高通量測(cè)序的方法監(jiān)測(cè)微生物群落結(jié)構(gòu)的變化情況。監(jiān)測(cè)結(jié)果顯示,在所有樣品中磺胺類(lèi)藥物耐藥基因的豐度較高,其中以sul1基因豐度最高,在土壤、底泥和水中的平均相對(duì)豐度分別達(dá)到8.15×10-1、3.12×10-1和2.31×10-1 copies/16S rDNA copies,高于之前文獻(xiàn)報(bào)告的豐度,環(huán)境中耐藥基因污染嚴(yán)重;結(jié)合各類(lèi)基因豐度大小

3、及其相關(guān)性分析,初步確定了每類(lèi)藥物耐藥基因中具有代表性的指示基因,即磺胺類(lèi)藥物的sul1基因,四環(huán)素類(lèi)藥物的tetM基因,喹諾酮類(lèi)藥物的aac(6’)-Ib基因,酰胺醇類(lèi)藥物的floR基因,β-內(nèi)酰胺類(lèi)藥物的blaTEM基因。在不同種類(lèi)環(huán)境樣品中,微生物群落基因豐度呈現(xiàn)土壤樣品>底泥>水的變化趨勢(shì)(p<0.05),而耐藥基因的相對(duì)總濃度(∑ARGs)表現(xiàn)為土壤顯著高于底泥和水。在不同的采樣季節(jié)之間,微生物群落(16S rDNA)的豐度和

4、耐藥基因的相對(duì)豐度(∑ARGs copies/16S rDNAcopies)均出現(xiàn)一定的變化,但無(wú)明顯的變化規(guī)律。
  對(duì)環(huán)境樣品的微生物結(jié)構(gòu)多樣性分析結(jié)果表明,不同種類(lèi)的環(huán)境樣本在不同季節(jié)其微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性存在一定的差異,其群落優(yōu)勢(shì)細(xì)菌為變形桿菌門(mén)(Proteobacteria)、擬桿菌門(mén)(Bacteroidetes)、放線菌門(mén)(Actinobacteria)、厚壁菌門(mén)(Firmicutes)和綠彎菌門(mén)(Chloroflex

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