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文檔簡介
1、楊屬,作為具有重要經濟和生態(tài)價值的落葉喬木樹種,其分布覆蓋整個北半球樹木分布的臨界范圍。不同楊屬樹種基因組全序列的測定,為通過比較關鍵等位基因的變異來研究不同楊屬樹種對不同環(huán)境的適應機制提供了基礎。
本研究以毛果楊基因組為參照序列共設計64對特異性引物,對楊屬29個樹種 Na+/H+逆向轉運蛋白基因家族(10個基因)進行全長 PCR擴增,運用CodonCode Aligner軟件對序列數(shù)據(jù)進行校對;通過PAML計算來檢測目的基
2、因是否在不同樹種間發(fā)生了結構變異和適應性進化;用 DnaSP、MEGA和ARLEQUIN等軟件進行DNA多態(tài)性分析,計算每個種的單倍型遺傳多樣性,并通過HKA和MKPRF等軟件對數(shù)據(jù)進行計算和中性檢驗,揭示Na+/H+逆向轉運蛋白基因家族在楊屬種間的分子進化機制。結果表明:白楊組的NHX5基因和胡楊組的NHX6、SOS1基因能夠檢測到正選擇信號;Na+/H+逆向轉運蛋白家族基因在胡楊和灰楊野生群體中普遍經歷了適應性進化。同時,研究發(fā)現(xiàn)胡
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