3、7型腺病毒纖毛與六鄰體基因序列分析.pdf

1、背景:2009年6月至2011年2月課題組從呼吸道感染住院患兒中共檢出人腺病毒(Human adenovirus，HAdV)陽(yáng)性標(biāo)本105份，其中3型55例，7型40例，5型4例，1型4例，55型1例，2型1例，而2010-2011年冬，腺病毒感染率激增。由于HAdV易發(fā)生血清型間重組現(xiàn)象。為進(jìn)一步明確是否因重組造成了HAdV的感染率激增，本研究分析比較前期臨床分離的3，7型HAdV纖毛(Fiber)與六鄰體(Hexon)蛋白的基因序列

2、。
　　方法:從2009年6月～2011年5月，收集因呼吸道感染在重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院呼吸病房住院患兒鼻咽抽吸物(Nasopharyngealaspirates，NAPs)1780例。所有標(biāo)本進(jìn)行HAdV PCR擴(kuò)增，腺病毒陽(yáng)性者測(cè)序，基因庫(kù)進(jìn)行比對(duì)確定血清型。對(duì)所有HAdV-B陽(yáng)性分別進(jìn)行Hexon高變區(qū)（Highly variable region，HVR）及纖毛蛋白基因PCR擴(kuò)增測(cè)序，并對(duì)3型和7型腺病毒進(jìn)行進(jìn)化樹(shù)分析(

3、Phylogeny analysis)及相似度分析(Similarity analysis)。根據(jù)已確定的腺病毒血清型進(jìn)行相關(guān)臨床資料分析，統(tǒng)計(jì)分析軟件使用SPSS17.0。
　　結(jié)果:重慶地區(qū)引起兒童急性呼吸道感染(Acute respiratory tractinfection，ARTI)的腺病毒血清型主要為3型和7型。Logestic回歸分析發(fā)現(xiàn)，HAdV-7相對(duì)于HAdV-3更容易致重癥肺炎(OR=0.089,95％CI0