DNA微陣列在結(jié)直腸腫瘤的APC基因異常研究中的應(yīng)用.pdf_第1頁(yè)
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1、東南大學(xué)碩士學(xué)位論文DNA微陣列在結(jié)直腸腫瘤的APC基因異常研究中的應(yīng)用姓名：高璐申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：生物科學(xué)與醫(yī)學(xué)工程指導(dǎo)教師：陸祖宏程璐20040401東南大學(xué)碩士學(xué)位論文Adenomatouspolyposiscoli(APC)geneisatumorsuppressorgenethatactastheonlygatekeeperincolorectalepitheliumproliferationcontrolwhosein

2、activationresultsinhyperproliferationandthenleadstotheformationofsmalladenomasAccordingtoKnudson’S、two—hitlhyperthesisinmostcolorectaltumorsAPCgeneisgreatlysilencedbymutationinexonregionandhypermethylationinpromoter1Aaer

3、aDevelopingefficientmethodforbothgeneticandepigeneticaberrancedetectioninAPCgenehasgreatimportancetoearlydiagnosisforcolorectaltumorsInthispaperweperformedbothtraditionalandDNAmicroarray—basedmethodsinmutationandmethylat

4、iondetectioninAPCgeneandprovedDNAmicroarrayasamoreeffectiveapproach1nthemutationpartbothDNAmicroarraybasedmethodandDHPLCtechniquewereusedinmutationdetectioninAPCexonregionsWefirsttested24sporadiccolorectalsampleswithagro

5、upofOligonucIeiOtideprobescomprising19mutationhotsoptsand2deletioncaseswerefound(83％)Thenwescreenedexon68andpartofexon15byDHPLCwiththesamesamplesAftersequencingvalidation5mutantcases(208％)werefoundincludingthetwobymicroa

6、rraymethodandtwonovelmutationeventsfG一Tat1257anddellaat1288)FromtheabovecomparisonwecanseetheDNAmicroarraymethodismoredirectlyinspecificsitedetectionbutnotgoodenoughasDHPLCinlargescalesequencescreening，Inthemethylationpa

7、rtweappliedbothMSPandDNAmicroarray—basedmethodsin24sporadiccolorectalsamplesforhypermethylationdetectioninAPCpromoter1AFormicroarraypreparationasetofoligonucleotideprobesweredesignedandimmobilizedonthealdehyde—coatedglas

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