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文檔簡介
1、目的:通過熒光標記的數(shù)字化PTT、DHPLC和DNA直接測序?qū)幭牡貐^(qū)散發(fā)性結(jié)直腸癌APC基因的不同外顯子進行檢測,研究本地區(qū)APC基因的突變位點及突變類型,分析 APC基因突變在散發(fā)性結(jié)直腸癌發(fā)病中的作用及與臨床病理參數(shù)之間的關(guān)系,同時探討熒光標記的數(shù)字化PTT在截短型APC基因突變檢測中的應(yīng)用價值,為結(jié)直腸癌早期診斷和早期治療提供理論依據(jù)。
方法:(1)樣本來源:收集寧夏醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院結(jié)直腸外科手術(shù)切除的無家族史結(jié)直腸癌患
2、者腫瘤組織標本150例、正常組織標本30例(遠離腫瘤10cm處的腸壁),同時收集相應(yīng)的臨床資料;(2)實驗方法:①采用變性高效液相色譜技術(shù)(Denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC)對APC基因第1~14外顯子進行篩查,篩查出的突變樣本進行測序;②采用熒光標記的數(shù)字化蛋白截短檢測技術(shù)(Protein truncation test, PTT)對50例結(jié)直腸癌組織的AP
3、C基因第15外顯子的截短型突變進行篩查,篩查出的突變樣本進行測序;③采用聚合酶鏈式反應(yīng)(Polymerase chain reaction, PCR)DNA直接測序法對APC基因15外顯子檢測;(3)實驗數(shù)據(jù)統(tǒng)計處理:方法采用卡方檢驗,以α=0.05為檢驗水準,運用SPSS18.0統(tǒng)計軟件包,對散發(fā)性結(jié)直腸癌組織APC基因的突變與臨床病理參數(shù)之間的相關(guān)性及熒光標記的數(shù)字化蛋白截短檢測技術(shù)和PCR-DNA直接測序在截短型突變檢出率上的比較
4、進行統(tǒng)計學(xué)分析。
結(jié)果:(1)采用DHPLC和DNA直接測序,100例腫瘤組織中發(fā)現(xiàn)34例體細胞突變,突變率34%(34/100),新發(fā)現(xiàn)兩個突變位點(c.3374T>C p.Val1125Ala, c.3811T>G p.Phe1271Val),截短型突變占總突變率的77.1%(27/35)),以無義突變?yōu)橹?7.8%(21/27)。(2)熒光標記的數(shù)字化PTT檢出15例截短型突變樣本,突變率為30%(15/50),對5例樣
5、本進行測序分別為(c.4099C>T, c.3925G>T, c.1450 C>T, c.2976_2977 insT),均導(dǎo)致截短蛋白的產(chǎn)生;(3)APC基因突變情況與結(jié)直腸癌的部位、組織分化程度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況、Dukes分期、CEA水平無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05);(4)熒光標記的數(shù)字化PTT具有快速、高效的特點和PCR-DNA直接測序在截短型突變檢出率上的比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(X2=0.083,P>0.05)。
結(jié)論
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