甘藍(lán)型油菜——諸葛菜附加系的基因表達(dá)研究.pdf

1、十字花科的諸葛菜(Orychophragmus violaceus(L.) O.E.Schulz，2n=24，OO)耐寒性耐陰性強(qiáng)、適生范圍廣、開紫花、種子含油量高、亞油酸比例較高，是一種很好的油料種質(zhì)資源。本研究利用甘藍(lán)型油菜（Brassica napusL.，2n=38，AACC）和諸葛菜的體細(xì)胞雜種(2n=62，AACCOO)與甘藍(lán)型油菜連續(xù)多代回交獲得的四個(gè)附加系（附加一條或一對諸葛菜染色體），分別表現(xiàn)諸葛菜花葉性狀（編號1）、

2、雌不育(S)、諸葛菜染色體上的rRNA基因?qū)τ筒说臑轱@性且花瓣基部有淡紫色(4)、諸葛菜染色體上的rRNA基因?qū)τ筒说臑椴糠诛@性(6)。通過這四個(gè)附加系的轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-seq)，開展如下研究:(1)諸葛菜染色體附加后對油菜基因組基因表達(dá)的影響;(2)諸葛菜rRNA基因的不同顯性程度對附加系基因表達(dá)的影響;(3)不同附加系基因表達(dá)的異同點(diǎn)。主要結(jié)果如下:
　　1.細(xì)胞學(xué)研究表明1、4、S號附加系含兩條諸葛菜染色體，6號含一條諸

3、葛菜染色體。RNA-seq與生物信息分析發(fā)現(xiàn)4號附加系基因表達(dá)改變程度最大，差異表達(dá)基因數(shù)為1號和S的1.5倍，為6號的2.5倍，6號改變最小。
　　2.甘藍(lán)型油菜中來自于C基因組的差異表達(dá)基因數(shù)比A基因組多，但是相對于整體基因組基因總數(shù)來說，A基因組基因的表達(dá)更易受到附加諸葛菜染色體的影響。在A、C基因組的三個(gè)亞基因組中(LF—the least fractionated blocks，MF1—themedium fractio

4、nated blocks，MF2—the most fractionated blocks)，MF1基因表達(dá)受到的影響最大，MF2的最小。
　　3.各個(gè)附加系中甘藍(lán)型油菜每條染色體上基因表達(dá)的差異顯示，不同的諸葛菜染色體傾向性地影響不同甘藍(lán)型油菜染色體的基因表達(dá)，引起染色體某一區(qū)段內(nèi)大量基因的同方向性差異表達(dá)。核仁顯性特異影響A5和C5染色體上基因的表達(dá)。
　　4.四個(gè)附加系DEGs的功能主要包括細(xì)胞組分、胞內(nèi)成分、胞內(nèi)細(xì)胞