扁桃及其它李屬物種微衛(wèi)星序列（SSR）突變機(jī)制和進(jìn)化模式分析.pdf

1、為了研究扁桃和其它李屬物種SSR的進(jìn)化模式和突變機(jī)制，扁桃EST序列經(jīng)序列拼接獲得重疊群，利用MISA軟件分別從冗余和非冗余序列中篩選SSR-EST序列。隨機(jī)挑選6個(gè)EST-SSR和2個(gè)桃基因組的SSR座位對(duì)李屬材料進(jìn)行SSR多態(tài)性分析，對(duì)所有8個(gè)座位中栽培扁桃的等位變異進(jìn)行片斷回收、克隆和測(cè)序，對(duì)其中4個(gè)座位的所有等位變異進(jìn)行序列分析，發(fā)現(xiàn)ASSR60的2個(gè)等位變異是由7個(gè)堿基缺失引起的，ASSR61座位是由于3個(gè)堿基缺失形成的2個(gè)等

2、位變異，多處位置的堿基替換存在種的特異性。編碼多聚泛素蛋白類似物基因中的ASSR4座位位于5'-UTR，屬于不完美3imp重復(fù)類型，等位變異是重復(fù)和側(cè)翼區(qū)5個(gè)堿基缺失共同作用的結(jié)果。編碼生長(zhǎng)素阻遏蛋白基因中的ASSR17座位位于3'-UTR，屬于(AG)15重復(fù)類型，等位變異是由于AG重復(fù)和側(cè)翼區(qū)indels所致。由此可見ASSR17座位SSR突變過程較為復(fù)雜，不能單純用一種模型來解釋。源于桃基因SSR的兩個(gè)座位BPPCT010和BPP