12435.配基的雜泛性的機制分析

1、分類號：華中農(nóng)業(yè)大學碩士學位論文配基的雜泛性的機制分析密級：ANALYSIS0NTHEPRoⅣⅡSCⅥTYoFTHELIGANDS研究生：王榮學號：2011304110186指導教師：孔德信副教授指導小組：陳玲玲教授馬彬廣副教授孔德信副教授專業(yè)：基因組學獲得學位名稱：理學碩士研究方向：計算機輔助藥物設計獲得學位時間：2014年6月華中農(nóng)業(yè)大學生命科學技術學院二。一四年六月配基的雜泛性的機制分析目錄摘墨要iAbstractii縮略語表ii

2、i1前言111配基雜泛性及其研究現(xiàn)狀1111配基物化性質(zhì)對其雜泛性的影響一3112配基的雜泛性與蛋白質(zhì)之間的關系一712本文的研究內(nèi)容與目的92材料和方法1021軟件及數(shù)據(jù)庫10211軟件10212數(shù)據(jù)庫1022分析方法11221數(shù)據(jù)的選擇與處理11222APOC方法簡介12223計算流程143結果與討論1531配基信息的提取1532配基物化性質(zhì)的分布18321配基物化性質(zhì)與其結合蛋白質(zhì)數(shù)目間的關系19322配基物化性質(zhì)與其結合的蛋白質(zhì)

3、種類間的關系2033配基結構間RMSD值的計算與分析25331配基結構間RMSD值計算25332配基結構間RMSD值的結果與討論263321配基RMSDMax值與其結合的蛋白質(zhì)之間的關系263322配基RMSD平均值與其結合的蛋白質(zhì)之間的關系2834蛋白質(zhì)結合腔的分析31341數(shù)據(jù)及計算流程31342結果分析323421配基RMSD值與蛋白質(zhì)結合腔相似性值分布323422配基與蛋白質(zhì)結合腔相似性結果展示343423配基與蛋白質(zhì)結合腔RM