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1、分類號(hào):密級(jí):學(xué)校代碼:學(xué)號(hào):遣掌師籠大擎10165201211000950碩’士學(xué)位論文一、二價(jià)金屬離子與氮一甲基乙酰胺~水分子的相互作用的理論研究作者姓名:學(xué)科、專業(yè):研究方向:導(dǎo)師姓名:李偉波物理化學(xué)理論與計(jì)算化學(xué)宮利東教授20l5年4月遼寧師范大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要金屬離子的重要性及其在化學(xué)和生物中的多樣性是毋庸置疑的,例如Li、Na、K、Be2、M92和Ca2在許多生物化學(xué)體系中起很重的作用。為了更好地了解金屬在生物體內(nèi)的生物功
2、能,探索金屬離子與生物大分子之間的相互作用非常重要。本文應(yīng)用量子化學(xué)方法對(duì)上述六種金屬離子與氮甲基乙酰胺0m【A)以及與水的相互作用進(jìn)行理論研究。并以量子化學(xué)方法的計(jì)算結(jié)果為依據(jù),應(yīng)用原子鍵電負(fù)性均衡浮動(dòng)電荷力場模型(ABEEMo“a:/MM)研究了M(NMA)。、M(H20)。(i=36)以及M(NMA)(I120)朋(M=Na,K,M92,Ca2;nm=3、4、6)體系的結(jié)構(gòu)、能量等性質(zhì)。首先,對(duì)M(NMA)一(M=Li,Na,K,
3、Be2,M92,Ca2;薩l~6)體系分別采用MP2方法和B3LYP、B3PW91、M062X三種密度泛函方法在631G(d,P)基組下進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化,并計(jì)算最穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的振動(dòng)頻率,比較不同NMA配位數(shù)下幾何結(jié)構(gòu),結(jié)合能,電子結(jié)構(gòu)等性質(zhì)。然后對(duì)MP2方法得到的穩(wěn)定結(jié)構(gòu),采用較高水平的基組MP2/631l舶(2d,2p)方法進(jìn)行能量計(jì)算。我們注意到,每增加一個(gè)NMA分子,金屬與NMA團(tuán)簇中羰基氧的距離尺舯變大,內(nèi)層NMA上的羰基鍵長犬c=0逐
4、漸變??;連續(xù)結(jié)合能降低;金屬離子上所帶的電荷隨NMA分子數(shù)增加而減小;。在ABEEMaTdMM模型下,以從頭算HF/STO3G方法的Mulliken電荷為基準(zhǔn),重新擬合了Na、K、M92以及Ca2的ABEEM參數(shù),并且構(gòu)建了描述金屬離子與NMA及金屬離子與水分子間相互作用的勢能函數(shù),利用該函數(shù)計(jì)算了M(NMA)。和M(H20)。(玎=3“)體系的結(jié)構(gòu)、電荷及結(jié)合能。與量子化學(xué)方法的計(jì)算結(jié)果相比,金屬離子與氧的距離滅M旬平均絕對(duì)偏差小于0
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