18582.一、二價金屬離子與氮甲基乙酰胺、水分子的相互作用的理論研究

1、分類號：密級：學(xué)校代碼：學(xué)號：遣掌師籠大擎10165201211000950碩’士學(xué)位論文一、二價金屬離子與氮一甲基乙酰胺～水分子的相互作用的理論研究作者姓名：學(xué)科、專業(yè)：研究方向：導(dǎo)師姓名：李偉波物理化學(xué)理論與計算化學(xué)宮利東教授20l5年4月遼寧師范大學(xué)碩士學(xué)位論文摘要金屬離子的重要性及其在化學(xué)和生物中的多樣性是毋庸置疑的，例如Li、Na、K、Be2、M92和Ca2在許多生物化學(xué)體系中起很重的作用。為了更好地了解金屬在生物體內(nèi)的生物功

2、能，探索金屬離子與生物大分子之間的相互作用非常重要。本文應(yīng)用量子化學(xué)方法對上述六種金屬離子與氮甲基乙酰胺0m【A)以及與水的相互作用進(jìn)行理論研究。并以量子化學(xué)方法的計算結(jié)果為依據(jù)，應(yīng)用原子鍵電負(fù)性均衡浮動電荷力場模型(ABEEMo“a：／MM)研究了M(NMA)。、M(H20)。(i=36)以及M(NMA)(I120)朋(M=Na，K，M92，Ca2；nm=3、4、6)體系的結(jié)構(gòu)、能量等性質(zhì)。首先，對M(NMA)一(M=Li，Na，K，

3、Be2，M92，Ca2；薩l～6)體系分別采用MP2方法和B3LYP、B3PW91、M062X三種密度泛函方法在631G(d，P)基組下進(jìn)行結(jié)構(gòu)優(yōu)化，并計算最穩(wěn)定結(jié)構(gòu)的振動頻率，比較不同NMA配位數(shù)下幾何結(jié)構(gòu)，結(jié)合能，電子結(jié)構(gòu)等性質(zhì)。然后對MP2方法得到的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)，采用較高水平的基組MP2／631l舶(2d，2p)方法進(jìn)行能量計算。我們注意到，每增加一個NMA分子，金屬與NMA團(tuán)簇中羰基氧的距離尺舯變大，內(nèi)層NMA上的羰基鍵長犬c=0逐

4、漸變?。贿B續(xù)結(jié)合能降低；金屬離子上所帶的電荷隨NMA分子數(shù)增加而減??；。在ABEEMaTdMM模型下，以從頭算HF／STO3G方法的Mulliken電荷為基準(zhǔn)，重新擬合了Na、K、M92以及Ca2的ABEEM參數(shù)，并且構(gòu)建了描述金屬離子與NMA及金屬離子與水分子間相互作用的勢能函數(shù)，利用該函數(shù)計算了M(NMA)。和M(H20)。(玎=3“)體系的結(jié)構(gòu)、電荷及結(jié)合能。與量子化學(xué)方法的計算結(jié)果相比，金屬離子與氧的距離滅M旬平均絕對偏差小于0