45508.條斑紫菜cdna微陣列制備與應用及錳超氧化物歧化酶基因克隆與序列分析

1、分類號奢曩——⑧研究生學位論文研究生姓名置癌重指導旗師姓名差蠡蘢翻熬撞申韻E倥數(shù)捌殖土專業(yè)名麓瀣灌塞麴堂論文答辯日期壟堂是至丑目學位授予日麓窒垡墮生璺且中國海洋大擎條斑紫菜cDNA微陣列制各與應用及錳超氧化物歧化酶基因克隆與序列分析的基因有24個。表達豐度發(fā)生改變的基因包括了脅迫應答，核酸代謝和蛋白質(zhì)代謝等多個方面。本研究中，利用自主研制的功能微陣列檢測發(fā)現(xiàn)，條斑紫菜配子體和孢子體間存在顯著的基因表達差異。比較微陣列檢測結(jié)果與已公開的2

2、萬多條條斑紫菜ESTs在不同世代中的分布頻率，可以看出二者間有較好的一致性，也證明了所研制微陣列在紫菜功能基因研究中具有較高的可靠性。抗氧化酶類在植物抗逆防御中具有重要作用，為研究紫菜抗逆的分子機制，根據(jù)條斑紫菜(Pyezoensis)表達序列標簽和全長eDNA富集文庫為基礎(chǔ)，采用PCR技術(shù)，克隆了條斑紫菜編碼錳超氧化物歧化酶(manganesesuperoxidedismutase，Mn—SOD)的cDNA及基因組DNA全長序列。研究

3、結(jié)果表明：該基因cDNA序列全長為958個核苷酸，包含一個完整Mn—SOD基因的ORF，編碼224個氨基酸和終止密碼子；該基因在基因組中序列長度為1416bp，包含4個外顯子和3個內(nèi)含子，這既不同于高等植物的6個外顯子和5個內(nèi)含子，也不同于人的5個外顯子和4個內(nèi)含子；該基因編碼區(qū)密碼子的平均GC含量為609％，第三位密碼子的GC含量高達849％；序列中包含四個與Mn2的結(jié)合位點及一個保守的金屬結(jié)合結(jié)構(gòu)域，預測分子量為2446909Da，

4、等電點為599；條斑紫菜Mn—SOD與人的相關(guān)蛋白具有類似的空間結(jié)構(gòu)，都有6個跨膜＆螺旋結(jié)構(gòu)域；由cDNA序列推導的氨基酸序列與萊茵衣藻(Chlamydomonasreinhardtii)相似性為577％，系統(tǒng)發(fā)生分析表明條斑紫菜Mn—SOD與綠藻萊茵衣藻和硅藻海鏈藻的親緣關(guān)系較近。本論文的研究，加深了對條斑紫菜重要性狀的遺傳基礎(chǔ)的認識，為選育具有抗病、抗逆、高品質(zhì)等優(yōu)良性狀的條斑紫菜新品種提供了有價值的信息，有利于推動紫菜產(chǎn)業(yè)的持續(xù)健