稻瘟病菌誘導水稻特異表達EST數(shù)據(jù)庫的建立及相關(guān)基因鑒定.pdf

1、1該研究對受稻瘟病菌誘導水稻葉組織特異表達cDNA文庫進行了大規(guī)模測序,共獲得有效EST序列15396條,其中14975條EST序列已被國際公共數(shù)據(jù)庫——GenBank數(shù)據(jù)庫接受.通過對所有已知功能基因的分析發(fā)現(xiàn),數(shù)據(jù)庫中與已知植物抗逆相關(guān)的蛋白有66類.涉及苯丙烷類代謝、氧代謝、氧化還原反應(yīng)、病程相關(guān)蛋白以及植物抵御高溫脅迫、低溫脅迫、光脅迫、水脅迫、植物創(chuàng)傷等相關(guān)的蛋白.證實水稻防御稻瘟病菌侵染的抗病過程是涉及眾多基因共表達的一個復

2、雜的網(wǎng)絡(luò)體系,并且與其它生物因子、非生物因子脅迫處理之間存在著密切的聯(lián)系.2有意思的是:通過與稻瘟病菌全基因組序列數(shù)據(jù)庫和水稻全基因組序列數(shù)據(jù)庫的BLASTn比對,對5633條獨立基因進行篩選,共檢出來源于稻瘟病菌的基因16條.3利用前期大規(guī)模測序的表達序列標簽,制備完成容量為1106條獨立基因的cDNA微陣列,對抗瘟性近等基因系H7R和H7S的表達譜分析發(fā)現(xiàn):在水稻樣本受到稻瘟病菌侵染8小時后,眾多的基因表達發(fā)生變化,在980組有效數(shù)