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文檔簡介
1、AAA-ATPases基因家族(ATPases associated with sever cellular activities)是一類具有特殊氨基酸序列,含有一個(gè)或兩個(gè)保守的AAA結(jié)構(gòu)域,與多種細(xì)胞活動(dòng)有關(guān)的ATPases類。AAA基因家族廣泛存在于動(dòng)物,植物,真菌以及原核生物中,參與蛋白降解、蛋白折疊、膜運(yùn)輸、細(xì)胞骨架調(diào)節(jié)和基因表達(dá)調(diào)控等多種生理活動(dòng)。相對(duì)動(dòng)物 AAA-ATPase基因家族的研究,對(duì)植物AAA-ATPase的功能和
2、作用機(jī)理研究相對(duì)較少,而關(guān)于水稻AAA-ATPase基因的研究鮮見報(bào)道。本研究室在前期的研究中,通過基因芯片發(fā)現(xiàn)水稻6個(gè)AAA-ATPase基因家族成員(暫命名為 OsAAA1-6)在稻瘟病抗病反應(yīng)中上調(diào)表達(dá)。為進(jìn)一步研究這6個(gè)基因的表達(dá)模式,本研究首先對(duì)水稻基因組的AAA-ATPase基因家族進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,然后分別利用植物生長調(diào)節(jié)劑ABA,ACC,BTH(SA功能類似物),CK,IAA,JA和GA,以及稻瘟病菌接種檢測這些基因
3、的表達(dá)情況,并且分析了這些基因在水稻的不同組織器官中的表達(dá)模式。結(jié)果如下:
(1)對(duì)日本晴基因組序列掃描分析發(fā)現(xiàn),水稻基因組中有26個(gè)AAA-ATPase基因家族成員。通過與已知AAA-ATPase基因比較分析,發(fā)現(xiàn)OsAAA1,OsAAA2,OsAAA3和OsAAA4與煙草參與抗病反應(yīng)的NtAAA1同源性較高。
(2)稻瘟病菌接種后,相對(duì)表達(dá)量分析表明OsAAA1、OsAAA2和OsAAA3均明顯受稻瘟病菌的上調(diào)表
4、達(dá),暗示這三個(gè)基因可能在這一抗病反應(yīng)中起重要作用。OsAAA4基因通過多次設(shè)計(jì)引物均沒有表達(dá)產(chǎn)物出現(xiàn),表明該基因可能是一個(gè)假基因。
(3)植物生長調(diào)節(jié)劑處理后,結(jié)果表明 OsAAA1受到 JA的顯著誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),說明該基因可能參與了JA信號(hào)傳導(dǎo)途徑。OsAAA2和OsAAA3均明顯受到BTH(SA功能類似物)的誘導(dǎo)上調(diào)表達(dá),表明這二個(gè)基因可能參與SA介導(dǎo)的信號(hào)途徑及其相關(guān)的生理活動(dòng)。
(4)對(duì)這5個(gè)基因在水稻不同組織
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