桃初級核心種質、關聯(lián)分析和紅肉性狀的圖譜定位.pdf

1、桃在世界果樹栽培中的地位十分重要，當前是溫帶果樹中僅次于蘋果和梨的樹種。桃經(jīng)過長期的自然選擇、栽培馴化和人工篩選，形成了豐富的桃種質資源。種質資源的收集整理、鑒定評價與創(chuàng)新利用一直是資源研究的基本方向。本研究基于國家果樹種質南京桃資源圃現(xiàn)有資源的收集保存，為了更好地理解桃種質遺傳多樣性、種質的遺傳背景、以及紅肉性狀的遺傳，開展了①基于表型性狀數(shù)據(jù)的桃初級核心構建研究，②使用分布8個連鎖群的SSR標記，評價地方品種資源的遺傳多樣性、遺傳結

2、構，并進行了基因型數(shù)據(jù)與表型數(shù)據(jù)的關聯(lián)分析，⑨在比較評價發(fā)現(xiàn)紅肉桃具有更高抗氧化能力的基礎上，分別進行了顯性與隱性2種遺傳類型的紅肉性狀的圖譜定位。研究結果如下:
　　1.桃初級核心種質構建
　　利用630份資源的60個描述項信息，通過比較分組、逐步聚類和隨機3類取樣方法，以及取樣比例的篩選，發(fā)現(xiàn):逐步聚類取樣方法優(yōu)于分組取樣和完全隨機取樣方法;逐步聚類取樣方法的最適取樣比例為15％;歐式距離和內平方距離法逐步聚類后優(yōu)先選取

3、高均偏種質的方法更適宜桃初級核心種質的構建。構建的桃初級核心種質包括99份資源，占原始庫的15.7％，具100％表型保留比例。經(jīng)多樣性指數(shù)、表型方差、變異系數(shù)檢驗以及數(shù)量性狀的均值和極差符合率檢驗，初級核心種質具有良好的代表性。
　　2.桃地方品種遺傳多樣性、群體結構和關聯(lián)分析
　　選用原始庫中158份收集于不同生態(tài)區(qū)的桃地方品種資源，以及27份育成品種和10份野生資源，進行了34個性狀的表型鑒定評價和49個SSR標記的基因

4、型鑒定。發(fā)現(xiàn):無論表型還是基因型，地方品種均具有豐富的多樣性。地方品種具有復雜的群體結構，表現(xiàn)為L(K)在1至15增加的過程中持續(xù)升高，而△K的最大值出現(xiàn)在K=2。在遺傳結構分析結果中介入傳統(tǒng)劃分的品種群概念，群體數(shù)量為8時能夠捕獲地方品種的主要群體結構，且K＞8后，群體結構僅發(fā)生微小的變化。地方品種總體連鎖不平衡(LD)水平較低，但是在不同的亞群體內，連鎖不平衡有所提高。通過關聯(lián)分析模型比較，發(fā)現(xiàn)使用親屬關系和群體結構的混合線性模型（

5、K+Q模型）比其它三種模型（K模型、Q模型和S模型）更加適于桃地方品種的關聯(lián)分析。研究發(fā)現(xiàn)了13個基因型和表型性狀間的關聯(lián)，涉及的性狀包括:果實大小、風味、可滴定酸、果實發(fā)育期、生長期和花期。關聯(lián)分析獲得的可滴定酸和花期的關聯(lián)標記可能會為相應性狀的分子標記輔助育種提供幫助。
　　3.不同肉色類型桃種質抗氧化能力的評價
　　以35份白肉桃、18份黃肉桃和22份紅肉桃為試材，測定并比較分析果皮、果肉和全果的總酚、花色苷、三價鐵還

6、原能力（FRAP）、相對抗自由基能力(RAC)以及色澤參數(shù)。發(fā)現(xiàn):紅肉桃抗氧化組份含量極顯著地高于白肉和黃肉桃，在全果水平，紅肉桃總酚含量為后兩者的4.1倍和4.6倍，花色苷含量分別為后兩者的20.1倍和11.6倍;紅肉桃抗氧化能力亦高于白肉和黃肉類型，F(xiàn)RAP分別是后兩者的5.8倍和6.2倍，RAC分別是后兩者的3.8倍和4.6倍。桃果實抗氧化能力與總酚和花色苷含量均呈極顯著的正相關。篩選出‘北京一線紅’、‘紅桃’等抗氧化能力高的紅肉

7、桃種質資源。
　　4.桃紅肉性狀的圖譜定位
　　分別以顯性和隱性遺傳的2種紅肉基因型桃為研究對象，通過傳統(tǒng)作圖的方法定位紅肉性狀。顯性遺傳基因型DBF的作圖群體為‘D6090’בHoneyBlaze’的80個單株;構建的遺傳連鎖圖譜包括102個SSR標記，分布于8個連鎖群，覆蓋562.3cM;紅肉顯性基因DBF被定位于第5連鎖群頂端，位于SSR標記AMPPG157和AMPPG178之間，匹配桃基因組序列的scaffold_