條班紫菜和壇紫菜SSR遺傳多樣性分析.pdf

1、條斑紫菜(Pyropiayezoensis)和壇紫菜(Pyropia haitanensis)是我國(guó)兩種最重要的經(jīng)濟(jì)海藻，為我國(guó)創(chuàng)造了很大一部分的經(jīng)濟(jì)價(jià)值，因此了解其遺傳背景對(duì)于開展紫菜的大規(guī)模栽培和進(jìn)行遺傳育種來(lái)說非常重要。
　　 本論文主要包括以下內(nèi)容：對(duì)壇紫菜和條斑紫菜微衛(wèi)星引物擴(kuò)增條件進(jìn)行篩選優(yōu)化，最終確定最優(yōu)的擴(kuò)增條件；利用篩選出來(lái)的SSR引物對(duì)11個(gè)壇紫菜樣品進(jìn)行遺傳多樣性分析；利用篩選出的SSR引物對(duì)青島、日照、連

2、云港、威海、煙臺(tái)5個(gè)地理群體樣品進(jìn)行遺傳多樣性分析。
　　 主要結(jié)果如下：
　　 (1)對(duì)軟件分析出的簡(jiǎn)單重復(fù)序列設(shè)計(jì)引物，得到壇紫菜和條斑紫菜SSR引物各36對(duì)和46對(duì)。通過不同擴(kuò)增條件的優(yōu)化篩選(主要是退火溫度的優(yōu)化)，篩選出可以擴(kuò)增出單一條帶的壇紫菜和條斑紫菜SSR引物各19對(duì)和12對(duì)，用于后期對(duì)壇紫菜和條斑紫菜的遺傳多樣性分析。
　　 (2)用篩選出的12對(duì)條斑紫菜SSR引物對(duì)從青島、日照、連云港、威海和

3、煙臺(tái)的野生群體和栽培群體進(jìn)行遺傳多樣性分析，11對(duì)引物具有多態(tài)性，共得到28個(gè)等位基因，平均每個(gè)位點(diǎn)的等位基因?yàn)?.55，位點(diǎn)遺傳多樣性比率(P)為91.67％。來(lái)自5個(gè)不同地理群體的SSR位點(diǎn)平均等位基因數(shù)(Na)、平均有效等位基因數(shù)(Ne)、平均Shannon多樣性指數(shù)(H)和香農(nóng)指數(shù)(I)分別為2.0000，1.4610，0.2862和0.4438。多態(tài)性指數(shù)最高和最低的引物分別是S12和PYM33。
　　 5個(gè)地理群體的

4、遺傳結(jié)構(gòu)分析表明，煙臺(tái)野生群體具有較高的遺傳多樣性，最低的是日照和連云港群體。其中，野生群體的平均觀測(cè)等位基因數(shù)(Na)、平均有效等位基因數(shù)(Ne)、平均多樣性指數(shù)(H)和香農(nóng)指數(shù)(I)分別為2.0000、1.4356、0.2746和0.4311，均高于栽培群體(Na=1.8571，Ne=1.4141，H=0.2611，I=0.4036)，表明目前我國(guó)條斑紫菜野生群體仍然保持較高的遺傳多樣性，栽培群體由于栽培過程中定向選擇的作用，使得其

5、遺傳多樣性低于野生群體。
　　 群體間遺傳分化結(jié)果顯示，群體間的遺傳分化系數(shù)(Gst)為0.1345，表明5個(gè)群體總的遺傳變異中有13.45％來(lái)自群體間，群體內(nèi)的遺傳變異為86.55％。說明群體間的遺傳分化水平很低，遺傳變異絕大部分存在于群體內(nèi)。
　　 (3)用篩選出的19對(duì)壇紫菜SSR引物對(duì)本實(shí)驗(yàn)室分離的11個(gè)壇紫菜純系材料進(jìn)行遺傳多樣性分析，其中10對(duì)引物具有多態(tài)性，共得到27個(gè)等位基因，多態(tài)位點(diǎn)百分率(P)為52.

6、6％。平均等位基因數(shù)(Na)、平均有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei基因多樣性指數(shù)(H)和Shannon多樣性指數(shù)(I)為1.9，1.4370，0.2712，0.4180，其中各項(xiàng)指數(shù)都以引物E7最大(Na=2.0，Ne=1.7901，H=0.4382，I=0.6294)、S3最小(Na=1.5，Ne=1.2382，H=0.1614，I=0.2518)。利用這10對(duì)引物分析11個(gè)壇紫菜品系，壇紫菜11個(gè)品系間的遺傳相似度在0.5185～0.