海島棉H276A-H276B AFLP分析與分子標簽發(fā)掘.pdf

1、棉花（Gossypium hirsutum L.）是我國重要的經(jīng)濟作物之一，在國民經(jīng)濟中占有重要地位。棉花具有強大的雜種優(yōu)勢，利用棉花細胞質(zhì)雄性不育系，實現(xiàn)“三系”配套長期以來是棉花育種家追求的目標。揭示植物細胞質(zhì)雄性不育(CMS)機理，為人工創(chuàng)造CMS種質(zhì)資源及有效調(diào)控CMS的表達提供理論依據(jù)，是國內(nèi)外關于植物CMS的重要研究方向。
　　本研究以劉冬梅等基于轉紅麻HcPDIL5-2a創(chuàng)造的海島棉細胞質(zhì)雄性不育系H276A為材料，

2、以其非轉基因保持系H276B（H276A的野生型）為對照，利用多態(tài)性豐富、穩(wěn)定性好、靈敏度高的AFLP分子標記技術，選擇256對選擇性擴增引物對其基因組DNA進行多態(tài)性分析，得出如下主要研究結果:
　　1、AFLP標記技術體系優(yōu)化
　　首先，本試驗建立了棉花幼葉高純度、高質(zhì)量的基因組DNA提取方法，在傳統(tǒng)CTAB法的基礎上結合純化柱式提取方法，所提取的DNA質(zhì)量可以滿足后續(xù)AFLP技術要求，完全適于其分析;其次，從模板用量、

3、酶切時間、連接產(chǎn)物及預擴增產(chǎn)物稀釋倍數(shù)等方面進行優(yōu)化，建立了最適于本試驗研究材料的AFLP標記技術體系和反應條件;最后，對變性聚丙烯酰胺凝膠的銀染做了優(yōu)化，使顯影效果更佳。
　　2、H276A與H276B的AFLP分析
　　利用AFLP標記技術，從DNA水平上對H276A、H276B進行分析，在256對選擇性擴增引物中，有17對引物能穩(wěn)定擴增出差異條帶，共獲得24條有無差異條帶，其中H276A有13條，多態(tài)性比例占2.63％

4、; H276B有11條，多態(tài)性比例占2.23％。對差異片段進行回收，最終成功回收到19條片段，大小主要集中在100-700bp之間。
　　3、差異片段克隆測序
　　純化回收后的目的片段經(jīng)連接轉化、菌液PCR檢測，最終成功檢測到13個大小與回收片段相同的差異片段，測序結果經(jīng)NCBI Blast比對分析，共得到6個陸地棉細胞質(zhì)基因同源序列。分別是2條葉綠體同源序列（均為ndhH基因的編碼序列），4條線粒體同源序列（其中兩條相同c

5、cmC基因上游非編碼區(qū)序列，一條nad6與sdh3編碼區(qū)基因之間的一段非編碼區(qū)序列，一條rps3基因的編碼序列）。通過對兩個材料的差異片段進行再克隆測序比對，共發(fā)現(xiàn)6個堿基替換，5個堿基缺失的突變。
　　4、分子標簽的開發(fā)
　　基于海島棉H276A、H276B線粒體基因ccmC上游保守區(qū)91bp處存在的一個堿基替換的差異，開發(fā)了兩個能特異區(qū)別海島棉不育系細胞質(zhì)的PCR分子標簽。通過對5對與H276同質(zhì)異核的海島棉不育系與保持