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文檔簡介
1、馬鈴薯晚疫病是由致病疫霉菌(Phytophthora infestans)引起的,可導(dǎo)致馬鈴薯莖葉死亡和塊莖腐爛的一種毀滅性卵菌病害,目前在世界各地馬鈴薯主產(chǎn)區(qū)均有發(fā)生,并且造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。近年來,隨著對非編碼RNA的研究,人們在動植物中發(fā)現(xiàn)了一類內(nèi)源性的、大小約22個堿基的單鏈非編碼RNA—microRNA(miRNA),它主要通過抑制或切割靶基因的方式調(diào)節(jié)細(xì)胞周期及個體發(fā)育過程。目前已有晚疫病菌株T30-4全基因組測序、小RN
2、A及RNAi通路的相關(guān)報(bào)道,但關(guān)于P.infestans中的micro-like RNA(milRNA)對靶基因的調(diào)控機(jī)制還不清楚。本研究基于利用Illumina小RNA高通量測序構(gòu)建的晚疫病菌株YN-YJ54.1三個生長階段的小RNA數(shù)據(jù)庫分析,及通過生物信息學(xué)預(yù)測的1000多個在動植物中比較保守的milRNAs及其靶基因。選取其中四個milRNAs: let-7,miR1491,miR1498及miR4066-3p為研究對象,通過N
3、orthern blot和qPCR對這些milRNAs進(jìn)行了雙重定性及定量檢測。通過qPCR和5'RACE發(fā)現(xiàn)在萌發(fā)孢子囊及菌絲中l(wèi)et-7通過不完全互補(bǔ)配對的方式對靶基因PIK-A的mRNA進(jìn)行切割調(diào)控,而在孢子囊中卻未發(fā)現(xiàn)該調(diào)控機(jī)制。
由于晚疫病菌直接或間接萌發(fā)長出牙管是其侵染宿主的必要階段,因此我們預(yù)測該靶基因在P.infestans對宿主的侵染過程中會起到重要作用。此結(jié)果可為以后應(yīng)用分子機(jī)制防治馬鈴薯晚疫病提供科學(xué)依據(jù)
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