中華鱘微衛(wèi)星DNA電泳圖譜的計(jì)算機(jī)自動(dòng)識(shí)別.pdf

1、作者在VB6.0語(yǔ)言平臺(tái)+Win2000環(huán)境下開(kāi)發(fā)了多倍體生物的DNA電泳圖譜識(shí)別程序.該文介紹了該程序識(shí)別分析多倍體微衛(wèi)星電泳圖譜的原理和工作實(shí)例.在單泳道識(shí)別模式下,利用已置入判別方程的程序?qū)ξ粗镜肋M(jìn)行識(shí)別,可以在對(duì)該泳道中所有泳帶進(jìn)行識(shí)別的同時(shí),判斷出該泳道中各泳帶的倍性.在多泳道識(shí)別模式下,程序結(jié)合自動(dòng)識(shí)別和手工校正,可以分析不同泳道的電泳結(jié)果,保存泳帶的位置、灰度、分子量等資料,并直接生成用于遺傳距離分析的(0,1)矩陣.在

2、使用該程序?qū)v年的中華鱘微衛(wèi)星DNA電泳圖譜進(jìn)行識(shí)別后,得到了485組有效數(shù)據(jù),將其中的365組數(shù)據(jù)作為訓(xùn)練集,120組數(shù)據(jù)作為測(cè)試集.訓(xùn)練集中1倍性泳帶188組,2倍性泳帶120組,3倍性泳帶32組,4倍性泳帶25組.在使用判別分析對(duì)所有的數(shù)據(jù)進(jìn)行分組判別以后得到了四組判別方程,在使用該判別方程對(duì)所有已知樣本進(jìn)行回判后,得到對(duì)1倍性泳帶判別的正確率為85.1﹪,對(duì)2倍性泳帶判別的正確率為90﹪,對(duì)3倍性泳帶判別的正確率為28.1﹪,對(duì)

3、4倍性泳帶判別的正確率為100﹪.就總體而言,數(shù)據(jù)回判的準(zhǔn)確性達(dá)到了82.7﹪.將作為測(cè)試集的120個(gè)泳帶樣本使用所獲得的判別方程進(jìn)行測(cè)試以檢測(cè)方程對(duì)未進(jìn)入模型泳帶的判別效果.對(duì)1倍性的泳帶的判別準(zhǔn)確率為82.3﹪;對(duì)2倍性的泳帶的判別準(zhǔn)確率為82.5﹪,對(duì)3倍性的泳帶的判別準(zhǔn)確率為27.3﹪,對(duì)4倍性的泳帶的判別準(zhǔn)確率為100﹪,總體判別的正確率為78.3﹪.表明該程序?qū)ξ粗編Ь哂休^好的判別能力.在對(duì)其它按四倍體遺傳的位點(diǎn)進(jìn)行大量的