莆田黑鴨MHC基因遺傳多態(tài)性研究.pdf

1、莆田黑鴨在我國(guó)飼養(yǎng)歷史悠久,分布范圍廣,是我國(guó)著名的高產(chǎn)蛋鴨之一,也是我國(guó)唯一的黑羽蛋鴨品種,已被列入國(guó)家級(jí)畜禽遺傳資源保護(hù)品種,在遺傳資源上是一個(gè)極為寶貴的基因庫(kù),對(duì)人類有著不可忽視的社會(huì)及經(jīng)濟(jì)意義。本研究利用PCR-SSCP方法對(duì)莆田黑鴨Anpl-MHCⅠ、Anpl-β2m及Anpl-MHCⅡ基因的遺傳多態(tài)性進(jìn)行研究,以找到新等位基因。通過(guò)研究,一方面可以豐富有關(guān)莆田黑鴨MHC的遺傳學(xué)理論資料,為地方品種保護(hù)提供理論基礎(chǔ);另一方面,

2、為進(jìn)一步研究MHC基因家族的功能奠定基礎(chǔ),并為抗病育種提供理論依據(jù)。分析結(jié)果如下:
　　 1.莆田黑鴨Anpl-MHCⅠ exon2,Anpl-MHCⅠ exon3和Anpl-MHCⅡβ exon2都具有豐富的多態(tài)性,其中Anpl-MHCⅠ exon2位點(diǎn)多態(tài)性最為豐富,其次為Anpl-MHCⅡβexon2、Anpl-MHCⅠ exon3,SNPs頻率分別為:32.43％、24.37％和19.93％。Anpl-MHCⅠ exon

3、4最低,僅為7.69％。
　　 2.莆田黑鴨MHC基因四個(gè)研究位點(diǎn)的氨基酸組成顯示,Anpl-MHCⅠ exon2、exon4和MHCⅡβ exon2位點(diǎn)編碼的氨基酸有明顯的疏水性,對(duì)維持MHC分子的結(jié)構(gòu)和功能起了重要作用。
　　 3.莆田黑鴨MHC基因4個(gè)位點(diǎn)的密碼子其相對(duì)使用頻率存在一定的差異,即該基因的4個(gè)研究位點(diǎn)存在密碼子偏倚性。
　　 4.通過(guò)PCR-SSCP技術(shù)分析莆田黑鴨Anpl-MHCⅠ exon

4、3、Anpl-MHCⅠβ和Anpl-MHCⅡβ exon2位點(diǎn)的多態(tài)性,除Anpl-β2m位點(diǎn)未檢測(cè)到多態(tài)性,其他兩個(gè)位點(diǎn)均檢測(cè)到4個(gè)等位基因。
　　 5.莆田黑鴨Anpl-MHCⅠ exon3和Anpl-MHCⅠ exon4位點(diǎn)核苷酸變異以轉(zhuǎn)換為主,Anpl-MHCⅠ exon2和Anpl-MHCⅡβ exon2以顛換為主。四個(gè)位點(diǎn)中只有Anpl-MHCⅠ exon2同義替換率大于非同義替換率。Anpl-MHCⅠ exon2和

5、exon4位點(diǎn)GC含量較高,分別為59％和63.8％。Anpl-MHCⅠ exon2和Anpl-MHCⅡβ exon2位點(diǎn)密碼子第三位GC含量最高,分別為82.7％和72.6％,受到的選擇壓最大。
　　 6.根據(jù)Popgene32計(jì)算獲得莆田黑鴨MHC基因Anpl-MHCⅠ exon3位點(diǎn)和Anpl-MHCⅡβ exon2位點(diǎn)的多態(tài)信息含量、雜合度及有效等位基因數(shù)。結(jié)果表明莆田黑鴨兩個(gè)位點(diǎn)的雜合度較低,且均具有豐富的遺傳多態(tài)性。