湖羊、東湖雜交羊MC4R、POMC、CSN3、β-lg基因多態(tài)性及其與生長性狀的相關(guān)性研究.pdf

1、本論文以湖羊和東湖雜交羊（東弗里升羊和湖羊的雜交一代）2個群體共298個個體為研究材料，在分析兩個群體生產(chǎn)性能的基礎(chǔ)上，采用DNA池PCR擴(kuò)增引物測序，發(fā)現(xiàn)了MC4R、POMC、CSN3、β-lg基因的34個堿基突變位點(diǎn)，運(yùn)用PCR-RFLP、CRS-PCR-RFLP技術(shù)對其中7個單核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(SNPs)的遺傳變異進(jìn)行檢測。同時，將這些SNPs位點(diǎn)與兩個群體體重和體尺指標(biāo)進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析，以篩選與綿羊經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的分子標(biāo)記，為今后培育

2、乳肉兼用型綿羊新品種提供試驗(yàn)依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:
　　1、湖羊與東湖雜交羊產(chǎn)肉和產(chǎn)奶性能分析
　　分析湖羊與東湖雜交羊六月齡的產(chǎn)肉性能（各10只）和產(chǎn)后20d的產(chǎn)奶指標(biāo)（各10只），發(fā)現(xiàn)湖羊的凈肉率顯著高于東湖雜交羊（P＜0.05），宰前活重、胴體重、屠宰率、肉骨比、肉色、pH值、失水率、眼肌面積等性狀方面，兩者之間差異不顯著（P＞0.05）。乳成分分析結(jié)果表明:兩者在乳脂率、乳蛋白和乳糖量方面差異極顯著（P＜0.01）

3、，東湖雜交羊的乳脂率極顯著高于湖羊，而乳蛋白、乳糖量則相反。
　　2、湖羊、東湖雜交羊MC4R基因多態(tài)性及其與生長性狀的相關(guān)性研究
　　本試驗(yàn)采用DNA池PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測序的方法共檢測到MC4R基因的10個SNPs(NM_001126370):g.110C/G、g.222C/T、g.306G/A、g.548C/T、g.706C/A、g.732C/G、g.951G/A、g.1229G/A、g.1267G/A和g.1291G/C

4、，其中除g.1229G/A位點(diǎn)在文獻(xiàn)中有報道外，其余均未見報道。g.222C/T、g.306G/A、g.548C/T、g.706C/A、g.732C/G和g.951G/A位于編碼區(qū)，除548位點(diǎn)C/T和732位點(diǎn)C/G突變?yōu)殄e義突變（分別導(dǎo)致蘇氨酸變?yōu)榈鞍彼幔惲涟彼嵬蛔優(yōu)榈鞍彼幔┩?，其余突變均為同義突變。g.110C/G、g.1229G/A、g.1267G/A和g.1291G/C位于非編碼區(qū)。應(yīng)用PCR-RFLP和CRS-PCR-RF

5、LP技術(shù)分別對編碼區(qū)的g.306G/A、非編碼區(qū)的g.1267G/A和編碼區(qū)的g.548C/T、g.706C/A多態(tài)位點(diǎn)進(jìn)行分析，結(jié)果表明:兩個群體除在306位點(diǎn)屬于中度多態(tài)外，在其余三個位點(diǎn)均屬于低度多態(tài)，且四個位點(diǎn)都偏離了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。
　　分析這四個突變位點(diǎn)的多態(tài)性與體重的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)除306位點(diǎn)與體重性狀無關(guān)外，其余位點(diǎn)均與體重相關(guān)。湖羊群體中g(shù).548C/T多態(tài)位點(diǎn)CT基因型個體的六月齡體重和4-

6、6月齡平均日增重顯著高于CC型個體（P＜0.05）;706位點(diǎn)CA型個體的6月齡重體和4-6月齡平均日增重極顯著高于CC型個體（P＜0.01），AA型個體的6月齡重和CA型個體的4-6月齡平均日增重顯著高于CC型個體(P＜0.05);1267位點(diǎn)GA型個體的2月齡斷奶重、4月齡重極顯著高于GG基因型個體(P＜0.01)，GA型個體的6月齡重顯著高于GG型個體（P＜0.05）。東湖雜交羊群體中g(shù).548C/T位點(diǎn)CT基因型的4月齡重、6月

7、齡重極顯著高于CC型個體(P＜0.01)，CT基因型的4-6月齡平均日增重顯著高于CC型個體（P＜0.05）;706位點(diǎn)AA型個體的初生重、2月齡斷奶重、6月齡重和4-6月齡平均日增重均極顯著高于CC型個體(P＜0.01);1267位點(diǎn)GA基因型個體的6月齡重極顯著高于GG型個體（P＜0.01），GA型個體的4月齡重顯著高于GG型個體(P＜0.05)。
　　分析這四個突變位點(diǎn)的多態(tài)性與四月齡體尺性狀的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)湖羊群體306多態(tài)

8、位點(diǎn)AA型個體的腰角寬顯著高于CA型個體(P＜0.05);548位點(diǎn)CT型個體的體長極顯著高于CC型個體(P＜0.01)，TT基因型個體的胸圍極顯著高于CC和CT型個體（P＜0.01）;706位點(diǎn)CA型個體的體長顯著高于CC型個體（P＜0.05）;1267位點(diǎn)GA型個體的體高、尻高顯著高于GG型個體(P＜0.05)。東湖雜交羊群體306位點(diǎn)GG和GA基因型個體的管圍極顯著高于AA型個體(P＜0.01);548位點(diǎn)CT型個體的體高（P＜0

9、.01）和尻高（P＜0.05）分別極顯著和顯著高于CC型個體;706位點(diǎn)AA基因型的體高、體長、腰角寬和管圍均極顯著高于CC型個體（P＜0.01），AA型個體的胸深顯著高于CC型個體（P＜0.05）;1267位點(diǎn)GA型個體的體高和管圍顯著高于AA型個體(P＜0.05)。
　　3、湖羊、東湖雜交羊POMC基因多態(tài)性及其與生長性狀的相關(guān)性研究
　　本試驗(yàn)采用DNA池PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測序技術(shù)檢測到POMC基因第3外顯子上的2個SNP

10、s(NM_001009266.1):g.273T/C和g.456G/A。對273位點(diǎn)進(jìn)行PCR-RFLP分析，發(fā)現(xiàn)該多態(tài)位點(diǎn)在湖羊群體中表現(xiàn)為中度多態(tài)，而在東湖雜交羊群體中未檢測到CC基因型，表現(xiàn)為低度多態(tài)，且該位點(diǎn)在兩個群體中均未達(dá)到Hardy-Weinberg平衡。
　　分析273位點(diǎn)的多態(tài)性與體重及四月齡體尺性狀的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)湖羊群體中CC基因型個體的2月齡斷奶重、四月齡尻高及TC基因型個體四月齡體長和管圍均顯著高于TT型個

11、體(P＜0.05);CC基因型個體的4月齡重、6月齡重極顯著高于TT和TC基因型個體(P＜0.01);CC基因型個體的四月齡體高和體長極顯著高于TT型個體(P＜0.01)，且顯著高于TC基因型個體(P＜0.05)。此外，CC型個體的管圍極顯著高于TT基因型個體（P＜0.01）。東湖雜交羊群體中TC基因型個體的2月齡斷奶重、4月齡重及四月齡體高、體長、胸深和管圍都顯著高于TT型個體（P＜0.05），TC型個體的6月齡重極顯著高于TT型個體

12、（P＜0.01）。
　　4、湖羊、東湖雜交羊CSN3、β-lg基因多態(tài)性及其與生長性狀的相關(guān)性研究
　　本試驗(yàn)采用DNA池PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測序技術(shù)檢測到CSN3基因的外顯子4的1個SNP(NM_001009378.1):g.237T/C和β-lg基因的啟動子區(qū)的21個SNPs(FR821261.1):g.167A/G、g.213T/C、g.235C/T、g.237C/T、g.239T/G、g.333G/T、g.357T/C、g

13、.368T/G、g.378C/T、g.415A/G、g.517C/A、g.700G/C、g.711G/A、g.1384G/A、g.1573G/A、g.1603C/T、g.1620A/G、g.1652C/G、g.1671T/C、g.1701A/C和g.1902A/T。應(yīng)用PCR-RFLP和CRS-PCR-RFLP技術(shù)分別對CSN3基因的g.237T/C和β-lg基因的g.1652C/G進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)g.237T/C位點(diǎn)在湖羊群體表現(xiàn)低度多

14、態(tài)，在東湖雜交羊群體表現(xiàn)中度多態(tài);g.1652C/G位點(diǎn)在該多態(tài)位點(diǎn)在兩個群體中都表現(xiàn)低度多態(tài);這兩個位點(diǎn)在兩個群體中都顯著偏離Hardy-Weinberg平衡（P＜0.05）。
　　分析CSN3基因237位點(diǎn)的多態(tài)性與體重及四月齡體尺性狀的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)該多態(tài)位點(diǎn)與兩個群體的生產(chǎn)性狀均無顯著性差異（P＞0.05）。
　　分析β-lg基因1652位點(diǎn)的多態(tài)性與體重及四月齡體尺性狀的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)湖羊群體CC型個體的4月齡重和四月