毛竹根部?jī)?nèi)生細(xì)菌多樣性研究.pdf

1、本研究采用培養(yǎng)方法和非培養(yǎng)方法（PCR-DGGE技術(shù)）對(duì)毛竹根部?jī)?nèi)生細(xì)菌和根際細(xì)菌多樣性進(jìn)行了研究。
　　 以天然林毛竹為樣品，利用LB和KB兩種培養(yǎng)基分離毛竹可培養(yǎng)根際細(xì)菌、根面細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌，結(jié)果表明毛竹根際細(xì)菌種群數(shù)量最高，其次為根面細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌。根據(jù)細(xì)菌菌落形態(tài)特征不同共分離獲得186株細(xì)菌，經(jīng)16SrDNA序列分析，92株根際細(xì)菌分為Firmicutes（66.3％）、Actinobacteria（18.5％

2、）和Proteobacteria（15.2％）三個(gè)分類單元，與34個(gè)已知細(xì)菌的序列同源性高于97％；54株根面細(xì)菌分為Firmicutes（70.4％）、Actinobacteria（24.1％）和Proteobacteria（5.5％）三個(gè)分類單元，與23個(gè)已知細(xì)菌的序列同源性高于97％；40株根部?jī)?nèi)生細(xì)菌分為Firmicutes（67.5％）、Actinobacteria（22.5％）和Proteobacteria（10.0％）三個(gè)

3、分類單元，與16個(gè)已知種的序列同源性高于97％。天然林毛竹根面細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌中均含有Gammaproteobacteria，所占比例分別為13.0％和32.5％；而毛竹根際細(xì)菌中沒有分離到這一類別的細(xì)菌。天然林毛竹根際細(xì)菌、根面細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌屬分別為Bacillus（42.4％）、Bacillus（44.4％）和Burkholderia（35.0％）。
　　 以天然林和人工林毛竹為樣品，采用非培養(yǎng)方法（PCR-D

4、GGE技術(shù)）研究毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌多樣性，結(jié)果表明天然林毛竹根際細(xì)菌多樣性最高，其次為人工林毛竹根際細(xì)菌和天然林毛竹根部?jī)?nèi)生細(xì)菌，人工林毛竹根部?jī)?nèi)生細(xì)菌多樣性最低。天然林、人工林毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌均包括Proteobacteria、Acidobacteria和Actinobacteria3個(gè)分類單元，各分類單元所占比例分別為：天然林毛竹根際細(xì)菌，58.8％、11.8％、29.4％；天然林毛竹根部?jī)?nèi)生細(xì)菌，66.6％、16

5、.7％、16.7％；人工林毛竹根際細(xì)菌，63.3％、9.1％、27.3％；人工林毛竹根部?jī)?nèi)生細(xì)菌，76.9％、15.4％、7.7％。天然林毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌屬分別為Terriglobus（8.8％）和Microbacterium（22.8％），而人工林毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌屬分別為Microbacterium（17.3％）和Pelomonas（11.5％）。此外，天然林、人工林毛竹根際和根內(nèi)細(xì)菌中存在著一些共

6、有的細(xì)菌種類，也存在著一些各自特有的細(xì)菌種類。DGGE電泳回收條帶中，51.9％條帶的序列與GenBank中不可培養(yǎng)細(xì)菌的序列相似性最高，表明天然林和人工林毛竹根際、根內(nèi)均具有大量的未培養(yǎng)細(xì)菌資源。
　　 利用傳統(tǒng)培養(yǎng)方法和非培養(yǎng)方法（DGGE技術(shù)）研究天然林毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌，兩種方法得到的細(xì)菌多樣性信息存在顯著差異。培養(yǎng)方法得到的毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌屬于Proteobacteria，Actinobacteria

7、和Firmicutes三個(gè)分類單元；而非培養(yǎng)方法得到的毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌屬于Proteobacteria、Actinobacteria和Acidobacteria三個(gè)分類單元。培養(yǎng)方法得到的毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌屬分別為Bacillus（42.4％）和Burkholderia（35.0％），而非培養(yǎng)方法得到的毛竹根際細(xì)菌和根部?jī)?nèi)生細(xì)菌的優(yōu)勢(shì)菌屬分別為Terriglobus（8.8％）和Microbacterium（2