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文檔簡介
1、微衛(wèi)星標(biāo)記以其數(shù)量多、分布廣、多態(tài)性豐富、檢測快速方便、共顯性遺傳等優(yōu)點而被廣泛應(yīng)用于個體識別、親子鑒定、遺傳多樣性分析、疾病診斷、構(gòu)建連鎖圖譜、基因定位等諸多領(lǐng)域,是最具應(yīng)用價值的標(biāo)記技術(shù)之一。本論文應(yīng)用微衛(wèi)星標(biāo)記對大菱鲆分子輔助育種相關(guān)方面進(jìn)行了探討,研究結(jié)果報道如下: PCR的優(yōu)化對微衛(wèi)星篩選是至關(guān)重要的,一般通過改變退火溫度,Mg2+濃度等因素來實現(xiàn),本研究利用本實驗室構(gòu)建的大菱鲆基因組文庫設(shè)計的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,優(yōu)化
2、了30對引物的PCR條件。利用大菱鲆51#家系的親本及100個子代為材料,對30對微衛(wèi)星標(biāo)記親本的分離方式進(jìn)行了分析。這些分離的標(biāo)記中,母本標(biāo)記有25個,父本標(biāo)記24個和共有標(biāo)記19個。經(jīng)卡方檢驗,其中偏離母本分離比例為16%,偏離父本分離比例為12.5%。 在優(yōu)化所得的30對大菱鲆微衛(wèi)星引物中挑選多態(tài)性高的10個標(biāo)記,對大菱鲆15個家系進(jìn)行了系譜鑒別和遺傳多樣性研究,評估這10個微衛(wèi)星標(biāo)記區(qū)分和鑒定大菱鲆家系的能力,進(jìn)一步探討
3、家系混養(yǎng)情況下利用微衛(wèi)星標(biāo)記輔助構(gòu)建大菱鲆家系,從而有效促進(jìn)大菱鲆良種選育進(jìn)程。10個微衛(wèi)星位點的平均多態(tài)信息含量為0.6746,平均雜合度為0.7142。10個微衛(wèi)星位點在15個家系分析中,共檢測到63個等位基因,每個位點的等位基因數(shù)在3-9個之間。根據(jù)已知親本及子代基因型,成功的推斷出了15個家系中缺失親本的基因型。經(jīng)Cervus3.0軟件對10個微衛(wèi)星基因座排除概率分析表明,在雙親未知的情況下累積排除概率是98.58%,已知單親時
4、累積排除概率達(dá)99.95%。UPGMA聚類分析結(jié)果表明,15個家系的297個子代被明顯的劃分為15個群體,92.6%的個體能夠正確的歸到家系,分類結(jié)果與系譜來源基本一致。結(jié)果表明,微衛(wèi)星標(biāo)記可以為大菱鲆混養(yǎng)家系進(jìn)行親權(quán)鑒定和系譜構(gòu)建提供技術(shù)支持。 用10個微衛(wèi)星標(biāo)記分析了15個家系親本間雜合度和距離指數(shù)d2對大菱鲆全長、體重的日增量的相關(guān)性,結(jié)果均表現(xiàn)為負(fù)相關(guān),且相關(guān)不顯著。親本間雜合度和d2對大菱鲆全長、體重的日增量建立多元回
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