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文檔簡介
1、1.本文利用12個微衛(wèi)星位點對大菱鲆(Scophthalmus maximusL.)四個引進地理群體進行遺傳多樣性分析。結果表明,等位基因數(shù)(A)為2~10個,平均等位基因數(shù)為4.3,有效等位基因數(shù)(Ne)為1.6~6.1,平均有效等位基因數(shù)2.7,各位點的雜合度期望值(He)為0.3823~0.8416。各群體之間無偏倚雜合度期望值由小到大依次為丹麥群體、英國群體、法國群體、挪威群體,運用SPSS軟件對無偏倚雜合度期望值進行Krusk
2、al-Wallis檢驗,結果(H=4.438,df=3,P=0.218)顯示四個地理群體的遺傳多樣性差異不顯著。群體間平均遺傳分化指數(shù)(Fst)為0.1117,各群體之間存在中度遺傳分化。用UPGMA法進行聚類分析,四個地理群體聚為兩類,挪威群體和丹麥群體聚為一類,法國群體和英國群體聚為一類。結合Hardy-Weinberg平衡和遺傳偏離指數(shù)(d),四個群體都不同程度的偏離平衡。四個群體具有一定的遺傳分化,較好的遺傳多樣性,適合作為大規(guī)
3、模家系選育的基礎群體。
2.文章利用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing repeats)法構建了大菱鲆的微衛(wèi)星DNA富集文庫,檢測結果證明該微衛(wèi)星DNA文庫的富集效率在39%左右。測序分析得知有101條克隆含有微衛(wèi)星DNA序列,共得到125個微衛(wèi)星DNA位點。其中完美型為92個,占73.6%;非完美型為27個,占21.6%;復合型6個,占4.8%。所得
4、到的微衛(wèi)星DNA的重復次數(shù)在5~96次之間,核心序列重復次數(shù)5~9次的占36.8%,重復次數(shù)10~19次的占35.2%平均重復次數(shù)為16.7。對所篩大菱鲆微衛(wèi)星DNA重復類型所占百分比的統(tǒng)計,重復類型最多的是(CA/GT)n占75%,其次是(CT/GA)n占16%,其余重復類型占的比重較小。結果顯示該方法可以較好的應用于大菱鲆微衛(wèi)星DNA位點的分離。這些微衛(wèi)星DNA標記的獲得將為大菱鲆遺傳多樣性分析、遺傳連鎖圖譜的構建及分子標記輔助育種
5、奠定良好的基礎。
根據(jù)分離所到大菱鲆微衛(wèi)星DNA位點,設計了85對引物,其中有56對能夠得到穩(wěn)定表達的產(chǎn)物。利用從四個不同地理群體隨機取得的30條的大菱鲆進行遺傳多樣性檢測結果有45對表現(xiàn)出多態(tài)性。這45個位點的等位基因數(shù)為2~19平均等位基因數(shù)為6.24,有效等位基因數(shù)為1.30~11.11平均值為3.66。期望雜合度為0.235~0.9254。多態(tài)信息含量為0.2044~0.9033平均值為0.622。45個多態(tài)性的位
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