西南地區(qū)本地黃牛及其雜交牛CAST、H-FABP、MyoD1基因部分編碼區(qū)多態(tài)性分析.pdf

1、鈣蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin，CAST)是一種內(nèi)源性的、需Ca2+激活的鈣蛋白酶抑制劑，可抑制肌肉內(nèi)蛋白質(zhì)降解，降低肌細(xì)胞生長(zhǎng)速度；屠宰后可抑制鈣蛋白酶的活性。研究表明，CAST基因的產(chǎn)物顯著影響肉的嫩度。心臟脂肪酸結(jié)合蛋白(Heart—Fatty Acid Binding Protein，H—FABP)基因的作用是將脂肪酸從細(xì)胞膜上運(yùn)送到脂肪酸氧化和甘油三脂及磷脂的合成位置，H—FABP基因的遺傳變異與肌內(nèi)脂肪(Intra

2、muscular Fat，IMF)含量存在相關(guān)性。生肌決定因子(Myogenic Detemination Gene，MyoD)基因不僅可促使靜止期的肌衛(wèi)星細(xì)胞向成肌細(xì)胞轉(zhuǎn)化，而且能把許多種類型細(xì)胞(如成纖維細(xì)胞、脂肪細(xì)胞等)轉(zhuǎn)化為成肌細(xì)胞，并可促進(jìn)成肌細(xì)胞進(jìn)一步融和、分化為成熟的肌纖維，在成肌過(guò)程中起主導(dǎo)作用。 本研究利用應(yīng)用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)—單鏈構(gòu)象多態(tài)性(Polymerase Chain Reaction—SingleStr

3、and Conformation Polymorphism，PCR—SSCP)技術(shù)和克隆測(cè)序方法對(duì)巴山黃牛、盤江黃牛、重慶山地黃牛、西雜牛、紅雜牛、昭通黃牛的CAST、H—FABP、MyoD1基因多態(tài)性和遺傳效應(yīng)進(jìn)行研究，以期為牛肉品質(zhì)的分子標(biāo)記輔助選擇提供基礎(chǔ)素材。 在CAST基因引物C1擴(kuò)增片段中檢測(cè)出2種基因型。在引物C2擴(kuò)增片段中，由148位T→C、第159位C→A和第191位A→G和位于內(nèi)含子中的第42位T→C和第68

4、-70位的插入片段形成多態(tài)，C1為優(yōu)勢(shì)基因，六個(gè)牛群體中昭通黃牛處于中度多態(tài)，其他群體都是低度多態(tài)。序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)在第148位點(diǎn)突變使酪氨酸→絲氨酸，第191位A→G引起丙氨酸→蘇氨酸，此位點(diǎn)可以作為肉品質(zhì)的侯選基因進(jìn)一步研究；引物C3的擴(kuò)增片段中，由位于外顯子第27位G→A、第124-127位點(diǎn)缺失片段和位于內(nèi)含子第182位G→A、第251位C→G形成多態(tài)，在4個(gè)地方群體牛中是F1為優(yōu)勢(shì)基因，2個(gè)雜交群體中是E1為優(yōu)勢(shì)基因，這個(gè)可能是人

5、工選擇引起的差異，六個(gè)牛群的PIC都處于中度多態(tài)，而且在該位點(diǎn)各個(gè)牛群體都處于Hardy—Weinberg平衡。在序列對(duì)比中發(fā)現(xiàn)在第27位點(diǎn)突變中G→A，使半胱氨酸→丙氨酸。此位點(diǎn)是否可以作為肉品質(zhì)基因的侯選基因需要進(jìn)一步研究。 對(duì)H—FABP基因引物H1擴(kuò)增片段進(jìn)行SSCP只發(fā)現(xiàn)單一條帶，說(shuō)明沒(méi)有多態(tài)性。在引物H2擴(kuò)增片段中出現(xiàn)3個(gè)等位基因，但只有3種基因型，此位點(diǎn)多態(tài)信息含量(PolymorphismInformation