綿羊H-FABP基因單核苷酸多態(tài)性及其與肉用性狀的關聯(lián)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本研究利用PCR-SSCP技術對綿羊H-FABP基因第2、3、4外顯子進行SNP檢測,分析基因的遺傳特性并尋找與肉質性狀相關的SNPs位點,利用實時熒光定量PCR法檢測了綿羊H-FABP基因在不同組織中的表達差異。結果如下:1. H-FABP基因第2外顯子存在4個突變位點:分別為g.939 A→G、g.980 G→A、g.1013 A→C、g.1018 T→C;第3外顯子存在3個突變位點:分別為g.2878 C→T、g.2956 C→T

2、、g.3017 G→A;第4外顯子不存在突變位點。
  2.對存在多態(tài)的exon2和exon3進行遺傳變異分析,分析了各個多態(tài)性座位在群體中的基因頻率、基因型頻率、多態(tài)信息含量、有效等位基因數(shù)和期望雜合度等群體遺傳學參數(shù)。分析發(fā)現(xiàn)e2、e3位點均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。4個綿羊群體內(nèi)e2位點的等位基因B為優(yōu)勢等位基因,在東北細毛羊、小尾寒羊和杜泊群體中,BB基因型為優(yōu)勢基因型,但在道賽特中,AB基因型為優(yōu)勢基因型

3、。東北細毛羊、杜泊和道賽特3個群體的多態(tài)信息含量(PIC)均處于0.25和0.50之間,屬于中度多態(tài)。小尾寒羊的多態(tài)信息含量小于0.25,為低度多態(tài)。e3位點的等位基因B為優(yōu)勢等位基因,BB基因型為優(yōu)勢基因型。除杜泊外,在東北細毛羊、小尾寒羊和道賽特中,不存在AA基因型。東北細毛羊和小尾寒羊的多態(tài)信息含量小于0.25,為低度多態(tài),杜泊和道賽特的多態(tài)信息含量(PIC)均處于0.25和0.50之間,屬于中度多態(tài)。
  3.采用一般線性

4、模型進行了H-FABP基因多態(tài)性與肉用性狀的關聯(lián)分析,結果顯示:基因型BB對剪切力有顯著的負效應(P<0.05),基因型BB對胴體重、凈肉重有一定的正面影響(P<0.05),基因型AA對屠宰率有負效應(P<0.05)。基因型BB對棕櫚酸含量有顯著的正效應(P<0.05),基因型BB型對硬脂酸、亞油酸含量有極顯著的負效應(P<0.01),基因型BB對谷氨酸、絲氨酸、蘇氨酸、丙氨酸含量以及氨基酸總和均有一定的負面影響(P<0.05),對脯氨

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