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文檔簡介
1、染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(ChIP)實(shí)驗(yàn)方法)實(shí)驗(yàn)方法實(shí)驗(yàn)原理實(shí)驗(yàn)原理染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(ChIP)通過與染色質(zhì)片段共沉淀和PCR技術(shù),在體內(nèi)檢測與特異蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA片段。ChIP技術(shù)最大的優(yōu)點(diǎn)就是在活體細(xì)胞狀態(tài)下研究了蛋白質(zhì)和目的基因結(jié)合狀況,減少了體外實(shí)驗(yàn)的誤差。在活體細(xì)胞中,先對與調(diào)節(jié)蛋白結(jié)合的染色質(zhì)進(jìn)行分離,然后通過一定的方法(例如:超聲波)隨機(jī)剪切染色質(zhì),用調(diào)節(jié)蛋白的抗體沉淀目的染色質(zhì),再通過一定手段把目的染
2、色質(zhì)上的蛋白質(zhì)去除掉,最后用PCR等方法檢測鑒定共沉淀的DNA片段的特性。儀器和試劑儀器和試劑真空設(shè)備、渦旋器、液氮、冷凍離心管、離心機(jī)、超聲波粉碎儀、miracloth提取緩沖液1(EB1):0.4M蔗糖;10mMTrisHCl,pH8.0;5mMβME;0.1mMPMSF;蛋白酶抑制劑混合物(aprotinin、pepstainA、Leupeptin、Antipain、TPCK、Benzaine)提取緩沖液2(EB2):0.25M蔗
3、糖;10mMTrisHCl,pH8.0;10mMMgCl2;1%TritonX100;5mMβME;0.1mMPMSF;蛋白酶抑制劑混合物(同上)提取緩沖液3(EB3):1.7M蔗糖;10mMTrisHCl,pH8.0;0.15%TritonX100;2mMMgCl2;5mMβME;0.1mMPMSF;蛋白酶抑制劑混合物(同上)核裂解緩沖液(NLB):50mMTrisHCl,pH8.0;10mMEDTA;1%SDS;1mMPMSF和蛋白
4、酶抑制劑混合物(同上)實(shí)驗(yàn)方法實(shí)驗(yàn)方法植物材料的準(zhǔn)備植物材料的準(zhǔn)備(以擬南芥為例)1液氮預(yù)冷研缽和杵子,液氮研磨幼苗成粉末狀。2在50ml管中加入30mlEB1懸浮組織。(此時(shí),EB1中不含甲醛)34層miracloth過濾組織到一個(gè)新的50ml管中。44℃,2880g離心20min。5小心去上清,1mlEB2重懸沉淀。6轉(zhuǎn)移至一個(gè)新的1.5ml離心管。74℃,12000g離心10min。8300ulEB3重懸沉淀。9轉(zhuǎn)入另一已加入30
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