MOLPRINT 2D應(yīng)用于有機(jī)污染物風(fēng)險評價的類比技術(shù)研究.pdf

1、有機(jī)污染物類比技術(shù)對于有機(jī)化合物的生態(tài)風(fēng)險性評價與管理具有重要意義，在歐美等發(fā)達(dá)國家已得到應(yīng)用。類比技術(shù)能夠簡單而快速地判別污染物的毒性級別，對其進(jìn)行大體上的分類，為環(huán)境風(fēng)險因子識別提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。 MOLPRINT2D是一個基于相似性原理的計算分子相似性的軟件，在計算機(jī)輔助藥物設(shè)計、食品和化妝品研究等相關(guān)領(lǐng)域都有應(yīng)用。該軟件通過表征分子結(jié)構(gòu)，采用Tanimoto方法計算相似性，具有計算快速，結(jié)果準(zhǔn)確的優(yōu)點。 本研究選

2、取了1093種有機(jī)污染物，以其中644種化合物為訓(xùn)練集，另外339種化合物和110種化合物作為兩個驗證集，以這些化合物對淡水四膜蟲(Tetrahymenapyriformis(strainGL-C))半數(shù)生長活性抑制濃度(pIGC50)為毒性指標(biāo)，應(yīng)用OpenBabel和MOLPRINT2D軟件，選取合適的計算參數(shù)，對驗證集化合物進(jìn)行相似性計算，并應(yīng)用此類比方法，對驗證集化合物毒性進(jìn)行了預(yù)測。具體工作包括： (1)利用Open

3、Babel和MOLPRINT2D軟件中的Mol22aefp程序，將數(shù)據(jù)集化合物分子結(jié)構(gòu)表示法由Smiles格式轉(zhuǎn)變?yōu)镾ybylmol2格式。然后應(yīng)用MOLPRINT2D軟件中的其他程序進(jìn)行后續(xù)計算。 (2)通過對數(shù)據(jù)的分析，選取最優(yōu)的分子結(jié)構(gòu)層次和分子結(jié)構(gòu)描述參數(shù)，以簡化對驗證集2的計算和分析的工作。 (3)根據(jù)對驗證集1的結(jié)論，提出利用MOLPRINT2D方法計算后的化合物分類方案，對驗證集2的化合物的半數(shù)生長活性