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文檔簡介
1、四川大學(xué)博士學(xué)位論文中國不同疫區(qū)L.d.ITS序列分析及L.p.PAL、HSP60基因克隆和真核表達姓名:田玉申請學(xué)位級別:博士專業(yè):病原生物學(xué)指導(dǎo)教師:陳建平20050429深入研究,從基因水平上進一步揭示我國不同疫區(qū)杜氏利什曼原蟲分離株之間的關(guān)系,從而在根本上為我國黑熱病的防治提供科學(xué)依據(jù)。核糖體存在于所有的原核生物和真核生物細胞內(nèi),主要功能是作為細胞中蛋白質(zhì)合成場所。利什曼原蟲編碼核糖體的基因r D N A 基因位于單一的染色體上
2、,頭尾相接,呈串珠狀,拷貝數(shù)為1 6 0 個重復(fù)單位。每個熏復(fù)單位均可編碼1 8 S R N A 、5 .8 S R N A 和2 8 S R N A ,編碼r R N A 基因長度為8 k b ,而重復(fù)單位之間為非轉(zhuǎn)錄的基因間隔區(qū)( N T S ) ,長度平均為8 .5 k b 。r D N A基因內(nèi)轉(zhuǎn)錄基因間隔區(qū)( I T S ) 平均長度為l k b 。由于r D N A 基因的高度保守性使其突變累積在成串重復(fù)排列的r R N A
3、 基因之間和兩側(cè)的間隔區(qū)序列中,而使核糖體基因間隔區(qū)序列具有種內(nèi)和種間、以及亞種和株的特異性,從而應(yīng)用于分類學(xué)和種株鑒定,I T S 的序列分析在植物、動物、真菌、原蟲等系統(tǒng)進化和分類學(xué)研究中已被廣泛應(yīng)用。本研究用P C R 方法擴增我國荒漠、山丘及平原疫區(qū)杜氏利什曼原蟲分離株L .d X J 7 7 1 ,L .d S C l 0 及厶d $ 1 9 2 的I T S 片段( 包含5 .8 SR N A 基因及其兩側(cè)的I T S l
4、和I T S 2 片段) ,分別將其克隆入p M D l 8 一T v e c t o r ,進行序列測定及分析。首次報道了我國荒漠、山丘和平原疫區(qū)杜氏利什曼原蟲分離株的I T S 序列及三者之間的差異。研究結(jié)果顯示:5 .8 S R N A 基因不論是這三個疫區(qū)分離株之間,還是與G e n e b a n k 內(nèi)其他利什曼原蟲分離株之間,其核苷酸序列一致性均達到9 9 %以上,充分顯示了r R N A 基因的保守性。而I T S l
5、及I T S 2 片段則在各分離株之間存在較大的差異性,也充分顯示了我國三個疫區(qū)分離株之間及與國外利什曼原蟲分離株之間同源程度的差異。其中三.d S C I O 與L d .S D 2 均缺失L .dX J 7 7 1 的I T S 2 片段第4 5 9 ~5 3 6 位共計7 8 個核苷酸序列,系國內(nèi)外首次報道。根據(jù)我國3 個疫區(qū)利什曼原蟲分離株的I T S 序列的差異,可推導(dǎo)出荒漠分離株、山丘分離株與平原分離株之間存在同源性的差異,
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